26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0790 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0790  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
395 aa  814    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.395295  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0113  NHL repeat containing protein  68.96 
 
 
397 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0109  NHL repeat containing protein  68.7 
 
 
397 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1812  NHL repeat containing protein  66.08 
 
 
397 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4601  NHL repeat-containing protein  66.93 
 
 
390 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3874  NHL repeat containing protein  65.62 
 
 
388 aa  512  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0711  NHL repeat protein  56.57 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0859  NHL repeat containing protein  56.57 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3206  NHL repeat-containing protein  53.62 
 
 
419 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3754  NHL repeat containing protein  51.88 
 
 
398 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0470  hypothetical protein  51.5 
 
 
371 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.043698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3798  NHL repeat-containing protein  43.05 
 
 
367 aa  269  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.88272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0477  NHL repeat containing protein  43.05 
 
 
368 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.517472  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2370  NHL repeat-containing protein  42.47 
 
 
397 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0112642 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3229  NHL repeat containing protein  43.13 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.657691  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1073  NHL repeat-containing protein  41.48 
 
 
362 aa  247  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0871328  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3876  NHL repeat containing protein  39.08 
 
 
379 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  26.58 
 
 
652 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  26.38 
 
 
472 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  23.26 
 
 
470 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  22.47 
 
 
487 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  22.12 
 
 
1079 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  19.94 
 
 
504 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  25.21 
 
 
623 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  26.85 
 
 
460 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  25.49 
 
 
1026 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>