More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3500 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3500  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
249 aa  507  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.760694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0476  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.14 
 
 
241 aa  300  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3054  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.2 
 
 
251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0735  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.9 
 
 
241 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.985131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2389  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.48 
 
 
241 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2453  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.63 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0904176  normal  0.167894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.49 
 
 
257 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2015  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.76 
 
 
260 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.28 
 
 
244 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2377  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.77 
 
 
244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4030  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.34 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.59 
 
 
249 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0473137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1538  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.95 
 
 
263 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.011975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.84 
 
 
255 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3868  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.91 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39528  normal  0.122725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.07 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3220  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.63 
 
 
236 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.418281  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.67 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3575  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.48 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.614267  normal  0.0350053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.5 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  40 
 
 
259 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2546  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.34 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.15 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0101999  normal  0.0780436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1756  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.15 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4864  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.93 
 
 
262 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.238308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  36.13 
 
 
255 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.46 
 
 
268 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.51 
 
 
273 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.63 
 
 
269 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0946  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.2 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.588556  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.21 
 
 
255 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0987  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.93 
 
 
260 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5215  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.29 
 
 
269 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0043  acyltransferase family protein  35.5 
 
 
268 aa  148  6e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1994  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  37.07 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1920  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.07 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3010  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.07 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2597  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.19 
 
 
264 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504702  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1149  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  37.5 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0562446  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0042  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.61 
 
 
240 aa  125  6e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0072  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  29.61 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.77 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.44 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1254  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.49 
 
 
241 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166419 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3081  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.15 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000181964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.36 
 
 
240 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0530  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.87 
 
 
249 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0626178 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3254  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.04 
 
 
248 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0407  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  26.38 
 
 
264 aa  104  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.650475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0546  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.44 
 
 
249 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.94 
 
 
254 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.94 
 
 
254 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0213  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.39 
 
 
254 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0954935 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.41 
 
 
254 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.71 
 
 
254 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.89 
 
 
254 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3693  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.57 
 
 
244 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.37 
 
 
254 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0642  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.95 
 
 
236 aa  99  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.51 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0398  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.09 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3747  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.91 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0236961  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.5 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.84 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.51 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  27.51 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  27.51 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.51 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  27.51 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0878  phospholipid and glycerol acyltransferase  27.51 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.51 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3069  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.0056603  hitchhiker  0.00898563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2324  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.57 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000640297  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.19 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  27.07 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0522  putative acyltransferase transmembrane protein  27.35 
 
 
250 aa  95.5  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00553836 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.82 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1223  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.67 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.32 
 
 
258 aa  94  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.07 
 
 
252 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.82 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0548  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.27 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2052  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  30.71 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4200  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.47 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  29.1 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0455  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.54 
 
 
251 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.47 
 
 
235 aa  92  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.19 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3378  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.41 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.611462  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0698  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.99 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.11 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.983241  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4741  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.8 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0357  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.16 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  28.03 
 
 
257 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0375  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.69 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0444  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.83 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.86 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2165  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.18 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2263  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.44 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2212  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.21 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>