More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2015 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2015  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0476  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.74 
 
 
241 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0735  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.21 
 
 
241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.985131  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3500  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.76 
 
 
249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.760694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2453  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.21 
 
 
241 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0904176  normal  0.167894 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2389  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.8 
 
 
241 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3054  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.45 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.83 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.87 
 
 
250 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.72 
 
 
264 aa  155  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1538  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.45 
 
 
263 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.011975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.55 
 
 
255 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  38.76 
 
 
255 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.83 
 
 
259 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1756  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.3 
 
 
263 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.04 
 
 
249 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0473137  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.3 
 
 
263 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0101999  normal  0.0780436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.57 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3220  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.6 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.418281  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.5 
 
 
273 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0946  phospholipid/glycerol acyltransferase  40 
 
 
269 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.588556  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4030  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.6 
 
 
303 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.18 
 
 
268 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.72 
 
 
269 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3868  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.9 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39528  normal  0.122725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4864  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.68 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.238308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.19 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0043  acyltransferase family protein  32.26 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3575  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.99 
 
 
265 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.614267  normal  0.0350053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.75 
 
 
259 aa  123  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3081  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.55 
 
 
232 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000181964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2377  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.57 
 
 
244 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5215  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.73 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0042  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.49 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2546  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.56 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.97 
 
 
255 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3747  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.17 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0236961  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.63 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0987  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.06 
 
 
260 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1920  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.51 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2597  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504702  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1994  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  32.64 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0072  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  32.07 
 
 
236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.89 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0407  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  29.58 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.650475  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1149  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  34.9 
 
 
241 aa  112  8.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0562446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.48 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3693  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.29 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3974  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.32 
 
 
231 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000150159  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3069  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.62 
 
 
261 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.0056603  hitchhiker  0.00898563 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3254  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.48 
 
 
248 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.27 
 
 
246 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4060  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.32 
 
 
231 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3010  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.24 
 
 
228 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3537  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.64 
 
 
250 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0406833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4396  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.04 
 
 
232 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000345745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.93 
 
 
252 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  30 
 
 
255 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0011  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.41 
 
 
255 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.57 
 
 
253 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.54 
 
 
252 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.05 
 
 
254 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.51 
 
 
254 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  30.96 
 
 
257 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.93 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4200  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.92 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  30.54 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3116  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  35.52 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2165  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.01 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4741  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.06 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.71 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0213  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.12 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0954935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0011  Protoheme IX farnesyltransferase  30.64 
 
 
240 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0363  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.51 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000581696  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0058  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.8 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000912039  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2212  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.83 
 
 
242 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.8 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000185774  normal  0.109161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2584  acyltransferase family protein  30.83 
 
 
242 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.46 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.46 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0548  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.2 
 
 
283 aa  96.3  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.99 
 
 
254 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0398  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.1 
 
 
250 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.41 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000544756 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1223  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.8 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0642  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.74 
 
 
236 aa  95.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.54 
 
 
254 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0546  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.28 
 
 
249 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.68 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0375  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.7 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0007  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.2 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000602556  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.1 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0455  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.21 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00080  LPA acyltransferase protein  32.87 
 
 
242 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.729238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  30.08 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  30.08 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  30.08 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.08 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.08 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.08 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>