More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3054 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3054  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
251 aa  511  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3500  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.2 
 
 
249 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.760694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0476  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.12 
 
 
241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0735  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.99 
 
 
241 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.985131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2389  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.99 
 
 
241 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2453  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.74 
 
 
241 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0904176  normal  0.167894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.72 
 
 
257 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.34 
 
 
264 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2015  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.45 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.51 
 
 
259 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.71 
 
 
250 aa  166  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.67 
 
 
255 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2377  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.32 
 
 
244 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.2 
 
 
244 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.65 
 
 
255 aa  158  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4864  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.94 
 
 
262 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.238308 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4030  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.95 
 
 
303 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.46 
 
 
269 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.04 
 
 
259 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.61 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0473137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0946  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.32 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.588556  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1538  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.43 
 
 
263 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.011975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5215  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.2 
 
 
269 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3868  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.02 
 
 
265 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39528  normal  0.122725 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  37.66 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2546  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.02 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3220  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.12 
 
 
236 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.418281  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3575  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.6 
 
 
265 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.614267  normal  0.0350053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.25 
 
 
273 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1756  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.49 
 
 
263 aa  144  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.49 
 
 
263 aa  144  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0101999  normal  0.0780436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.71 
 
 
268 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0987  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.76 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1994  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  34.18 
 
 
260 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1920  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.18 
 
 
300 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3010  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.63 
 
 
228 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0043  acyltransferase family protein  31.09 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0042  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.49 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0072  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  31.09 
 
 
236 aa  128  8.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2597  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504702  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1149  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  32.05 
 
 
241 aa  120  9.999999999999999e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0562446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1254  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.19 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3747  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.91 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0236961  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.21 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0530  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.33 
 
 
249 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0626178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0546  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.9 
 
 
249 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.64 
 
 
240 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3254  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.41 
 
 
248 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  30 
 
 
258 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.24 
 
 
251 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.42 
 
 
255 aa  99  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1223  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.86 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.63 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.8 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0407  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  28.27 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.650475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  26.36 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0878  phospholipid and glycerol acyltransferase  26.36 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  26.36 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  26.36 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.36 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.36 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.36 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  27 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3081  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.08 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000181964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  26.74 
 
 
259 aa  92.8  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.67 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.67 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.8 
 
 
246 aa  92  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.39 
 
 
252 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.88 
 
 
250 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.69 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0957  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.43 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4741  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.9 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3693  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.24 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4200  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.24 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0444  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.82 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2165  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.53 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  27 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0522  putative acyltransferase transmembrane protein  26.02 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00553836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3537  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.9 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0406833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.15 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  27 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.24 
 
 
252 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0548  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
283 aa  89  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.28 
 
 
244 aa  88.6  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.983241  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  27.69 
 
 
257 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2324  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.81 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000640297  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0642  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.84 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0455  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.03 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2212  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.9 
 
 
242 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2584  acyltransferase family protein  29.9 
 
 
242 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0213  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.91 
 
 
254 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0954935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0357  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.55 
 
 
249 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0398  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.71 
 
 
250 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  25.21 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0698  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.19 
 
 
230 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00080  LPA acyltransferase protein  27.1 
 
 
242 aa  85.5  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.729238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2690  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.05 
 
 
222 aa  85.5  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.03 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3069  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.6 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.0056603  hitchhiker  0.00898563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>