More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3010 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3010  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2889  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.37 
 
 
243 aa  181  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.532802  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0698  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.42 
 
 
230 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.77 
 
 
257 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.91 
 
 
273 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  42.36 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.29 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1994  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  43.64 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1920  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.44 
 
 
300 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0987  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.99 
 
 
260 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.01 
 
 
259 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.57 
 
 
255 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2377  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.3 
 
 
244 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.01 
 
 
259 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3220  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.34 
 
 
236 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.418281  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4864  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.73 
 
 
262 aa  151  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.238308 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3069  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.04 
 
 
261 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.0056603  hitchhiker  0.00898563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2546  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.53 
 
 
259 aa  148  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4030  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.09 
 
 
303 aa  148  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3868  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.71 
 
 
265 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39528  normal  0.122725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.64 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0043  acyltransferase family protein  37.9 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3575  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.17 
 
 
265 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.614267  normal  0.0350053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5215  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.74 
 
 
269 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.74 
 
 
240 aa  145  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3081  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.45 
 
 
232 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000181964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.59 
 
 
244 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.79 
 
 
269 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0946  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.16 
 
 
269 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.588556  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3500  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.07 
 
 
249 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.760694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0735  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.8 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.985131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.64 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2389  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.8 
 
 
241 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3054  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.63 
 
 
251 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3747  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.24 
 
 
244 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0236961  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2453  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.8 
 
 
241 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0904176  normal  0.167894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.12 
 
 
249 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0473137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2324  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.09 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000640297  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.1 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1538  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.75 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.011975 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0072  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  36.9 
 
 
236 aa  124  9e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  36 
 
 
252 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.36 
 
 
268 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.32 
 
 
254 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.75 
 
 
254 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.9 
 
 
254 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0398  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
250 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.9 
 
 
254 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.16 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.02 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  34.02 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  34.02 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.02 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0042  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.14 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0878  phospholipid and glycerol acyltransferase  34.02 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0476  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.38 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  34.02 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.02 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.32 
 
 
254 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.64 
 
 
263 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0101999  normal  0.0780436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.32 
 
 
254 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1756  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.64 
 
 
263 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.32 
 
 
254 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0530  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.92 
 
 
249 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0626178 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.24 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  33.61 
 
 
259 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0546  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.5 
 
 
249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0548  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.68 
 
 
283 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0642  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.29 
 
 
236 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1149  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  37.5 
 
 
241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0562446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3537  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.29 
 
 
250 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0406833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3254  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.76 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0455  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.62 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.69 
 
 
250 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3378  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.85 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.611462  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.51 
 
 
252 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0213  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.8 
 
 
254 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0954935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.5 
 
 
255 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0187  hdtS protein  33.96 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0375  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.78 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.83 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.02 
 
 
256 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00250914  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0444  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.02 
 
 
253 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0522  putative acyltransferase transmembrane protein  32.79 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00553836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0357  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.28 
 
 
249 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3693  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.62 
 
 
244 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2052  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  32.19 
 
 
249 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0505  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.68 
 
 
249 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2165  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.78 
 
 
283 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131735  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  34.6 
 
 
257 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4200  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.83 
 
 
256 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.04 
 
 
253 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2584  acyltransferase family protein  34.4 
 
 
242 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2212  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.4 
 
 
242 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4741  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.98 
 
 
258 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3974  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.61 
 
 
231 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000150159  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2015  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.24 
 
 
260 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  34.76 
 
 
257 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2597  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.59 
 
 
264 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504702  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>