More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4864 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4864  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
262 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.238308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.57 
 
 
269 aa  417  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0946  phospholipid/glycerol acyltransferase  73.28 
 
 
269 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.588556  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5215  phospholipid/glycerol acyltransferase  72.2 
 
 
269 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  65.76 
 
 
255 aa  353  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.35 
 
 
255 aa  342  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.05 
 
 
259 aa  326  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.79 
 
 
264 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.42 
 
 
259 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1538  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.1 
 
 
263 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.011975 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4030  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  46.89 
 
 
303 aa  240  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.41 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  50 
 
 
273 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1756  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.38 
 
 
263 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.38 
 
 
263 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0101999  normal  0.0780436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.52 
 
 
250 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0987  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.61 
 
 
260 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3868  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.21 
 
 
265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.39528  normal  0.122725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2546  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.21 
 
 
259 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.9 
 
 
244 aa  219  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3575  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.35 
 
 
265 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.614267  normal  0.0350053 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1920  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.93 
 
 
300 aa  218  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1994  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  43.93 
 
 
260 aa  218  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.26 
 
 
249 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0473137  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3088  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.03 
 
 
268 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0043  acyltransferase family protein  41.08 
 
 
268 aa  198  7.999999999999999e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.67 
 
 
255 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3220  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.85 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.418281  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2377  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.04 
 
 
244 aa  181  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.10108 
 
 
-
 
NC_002978  WD1149  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  37.19 
 
 
241 aa  177  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0562446  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2453  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.84 
 
 
241 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0904176  normal  0.167894 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3500  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.93 
 
 
249 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.760694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0735  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.27 
 
 
241 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.985131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2389  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.27 
 
 
241 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3054  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.94 
 
 
251 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6031  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.11 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  36.25 
 
 
259 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.75 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0642  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.4 
 
 
236 aa  152  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0699  acyltransferase family protein  35 
 
 
259 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2731  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.24 
 
 
254 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2348  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35 
 
 
259 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0216  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  35 
 
 
259 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0878  phospholipid and glycerol acyltransferase  35 
 
 
259 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2730  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35 
 
 
259 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0714  acyltransferase family protein  35 
 
 
259 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2428  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35 
 
 
259 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.75 
 
 
254 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0398  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.22 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.21 
 
 
257 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.78 
 
 
254 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2092  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.62 
 
 
254 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.389917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2704  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.62 
 
 
254 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.130434  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3010  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.73 
 
 
228 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0042  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.31 
 
 
240 aa  148  7e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.86 
 
 
251 aa  148  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0522  putative acyltransferase transmembrane protein  36.36 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00553836 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3254  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.62 
 
 
248 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0413  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.46 
 
 
250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.661287  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0375  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.81 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0403  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.65 
 
 
252 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.355524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.12 
 
 
258 aa  143  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  38.69 
 
 
257 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  38.19 
 
 
257 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0187  hdtS protein  32.61 
 
 
256 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0444  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.86 
 
 
253 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2324  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.05 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000640297  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.21 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00250914  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0213  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.89 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0954935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0505  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.63 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3747  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.18 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0236961  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0476  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.34 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0548  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.64 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2597  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.22 
 
 
264 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.504702  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0684  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357899  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3378  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.5 
 
 
254 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.611462  normal  0.54749 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4015  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0066125  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0407  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  34.3 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.650475  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1866  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.92 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2345  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.5 
 
 
240 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.422159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3069  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.31 
 
 
261 aa  135  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.0056603  hitchhiker  0.00898563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0009  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.06 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0072  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  32.48 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0011  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.5 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0011  Protoheme IX farnesyltransferase  34.48 
 
 
240 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1291  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.51 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.302513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0546  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.19 
 
 
249 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3081  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.41 
 
 
232 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000000181964  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2015  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.68 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5696  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.53 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.226605 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2052  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  34.95 
 
 
249 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.29 
 
 
261 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000544756 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.54 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.983241  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00080  LPA acyltransferase protein  35.9 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.729238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0530  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.77 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0626178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1223  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.25 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0058  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.62 
 
 
261 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000912039  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.62 
 
 
261 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000185774  normal  0.109161 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1022  putative acyltransferase  34.01 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508637  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3693  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.94 
 
 
244 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.869858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>