More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1118 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.62 
 
 		 741 aa  839    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  80.33 
 
 		 723 aa  1179    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  78.19 
 
 		 740 aa  1137    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.99 
 
 		 727 aa  798    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.39 
 
 		 740 aa  924    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.33 
 
 		 741 aa  851    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1308  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.68 
 
 		 737 aa  835    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.38 
 
 		 743 aa  887    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2951  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  78.33 
 
 		 746 aa  1140    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.81 
 
 		 740 aa  931    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.62 
 
 		 759 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.36 
 
 		 740 aa  803    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.98 
 
 		 759 aa  711    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.53 
 
 		 737 aa  850    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.11 
 
 		 736 aa  822    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.23 
 
 		 719 aa  787    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  79.75 
 
 		 719 aa  1159    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.72 
 
 		 736 aa  822    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.53 
 
 		 736 aa  826    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1786  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.95 
 
 		 736 aa  816    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.2 
 
 		 744 aa  888    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.33 
 
 		 741 aa  851    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.41 
 
 		 736 aa  834    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.77 
 
 		 744 aa  841    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.38 
 
 		 767 aa  709    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.83 
 
 		 768 aa  657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1118  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 		 721 aa  1475    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  56.46 
 
 		 747 aa  812    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.84 
 
 		 737 aa  739    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.38 
 
 		 733 aa  652    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.01 
 
 		 741 aa  637    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.75 
 
 		 744 aa  915    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.2 
 
 		 724 aa  841    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.39 
 
 		 740 aa  924    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0894  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  77.08 
 
 		 719 aa  1123    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.19 
 
 		 741 aa  800    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.97 
 
 		 735 aa  855    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.7 
 
 		 739 aa  884    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3971  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  76.67 
 
 		 723 aa  1078    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.16 
 
 		 745 aa  886    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.54 
 
 		 735 aa  859    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.67 
 
 		 737 aa  850    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.16 
 
 		 759 aa  721    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1505  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.81 
 
 		 743 aa  889    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.89 
 
 		 741 aa  826    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.22 
 
 		 737 aa  889    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.71 
 
 		 749 aa  833    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.53 
 
 		 737 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.27 
 
 		 761 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.24 
 
 		 737 aa  628  1e-178  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.56 
 
 		 733 aa  624  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.52 
 
 		 744 aa  625  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.12 
 
 		 742 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.1 
 
 		 739 aa  617  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.34 
 
 		 742 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.81 
 
 		 739 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.81 
 
 		 739 aa  612  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.81 
 
 		 739 aa  612  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.81 
 
 		 739 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.81 
 
 		 739 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.81 
 
 		 739 aa  609  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.66 
 
 		 739 aa  612  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.81 
 
 		 739 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.81 
 
 		 739 aa  611  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.81 
 
 		 739 aa  612  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.58 
 
 		 729 aa  606  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.57 
 
 		 729 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.57 
 
 		 729 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.84 
 
 		 732 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.629797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.08 
 
 		 729 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.85 
 
 		 733 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.05 
 
 		 750 aa  599  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.29 
 
 		 733 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0556  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.62 
 
 		 731 aa  592  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.624203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.29 
 
 		 764 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.15 
 
 		 739 aa  589  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.11 
 
 		 758 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.29 
 
 		 777 aa  587  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.68 
 
 		 728 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.49 
 
 		 752 aa  586  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.42 
 
 		 761 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1035  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.23 
 
 		 728 aa  585  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0978  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.68 
 
 		 728 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.74135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.57 
 
 		 730 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.49 
 
 		 760 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.37 
 
 		 725 aa  578  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.05 
 
 		 760 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.95 
 
 		 761 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.72 
 
 		 736 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.07 
 
 		 761 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.93 
 
 		 770 aa  572  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46 
 
 		 754 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.07 
 
 		 734 aa  566  1e-160  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.29 
 
 		 758 aa  568  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.15 
 
 		 777 aa  568  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.1 
 
 		 746 aa  567  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.15 
 
 		 767 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.21 
 
 		 766 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.28 
 
 		 802 aa  559  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.22 
 
 		 767 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>