More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1026 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1026  acyl carrier protein  100 
 
 
78 aa  154  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177026  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  53.33 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  47.44 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0725  acyl carrier protein  51.32 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  52.7 
 
 
77 aa  76.6  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  52.7 
 
 
77 aa  76.6  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  53.33 
 
 
77 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  52 
 
 
80 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  48.65 
 
 
74 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  49.32 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  50.68 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  49.33 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  46.58 
 
 
75 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  48.05 
 
 
77 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  46.58 
 
 
79 aa  73.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  47.37 
 
 
77 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  48.65 
 
 
74 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  47.37 
 
 
78 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  46.75 
 
 
78 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  47.37 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  44.87 
 
 
79 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  44.74 
 
 
79 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  48.72 
 
 
81 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  46.75 
 
 
78 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  44.87 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  48 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  49.32 
 
 
78 aa  72  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  49.32 
 
 
78 aa  72  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  47.37 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  44.87 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  48.61 
 
 
75 aa  72  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  48.65 
 
 
77 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  49.32 
 
 
78 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  46.58 
 
 
80 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  44.87 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  44.16 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  47.3 
 
 
77 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  47.3 
 
 
77 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  44.16 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  45.45 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  47.3 
 
 
77 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  44.16 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  50.68 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  46.58 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  47.37 
 
 
80 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1587  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  44.16 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  44.74 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  46.05 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1644  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.28963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  49.32 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  43.42 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  45.45 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  43.42 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  44.87 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  50.68 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  50.68 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  46.67 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  46.67 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  47.3 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  45.45 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  47.3 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40310  putative acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0674269  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  44.44 
 
 
77 aa  70.1  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  49.32 
 
 
77 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  46.05 
 
 
79 aa  70.1  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  46.67 
 
 
78 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  45.95 
 
 
78 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  44.74 
 
 
80 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3419  acyl carrier protein  43.24 
 
 
79 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  49.32 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  70.1  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  45.95 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  44.16 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  47.3 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  50 
 
 
77 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  46.05 
 
 
78 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  46.58 
 
 
73 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  43.42 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  42.31 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  42.11 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  45.21 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  41.03 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  45.21 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  41.56 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  41.03 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  41.03 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  41.03 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  41.03 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>