157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0005 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0005  L-threonine aldolase, low-specificity  100 
 
 		 351 aa  731    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  55.85 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  53.04 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1162  Threonine aldolase  52.96 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  50.29 
 
 		 344 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0883  hypothetical protein  48.68 
 
 		 341 aa  345  6e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1756  hypothetical protein  48.37 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  50 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08120  L-threonine aldolase  47.48 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000672977  hitchhiker  0.0000000548027 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1377  hypothetical protein  47.34 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1404  hypothetical protein  47.34 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.265494  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  47.79 
 
 		 345 aa  328  8e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  46.84 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0857  threonine aldolase  46.61 
 
 		 341 aa  318  7e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2927  Threonine aldolase  44.74 
 
 		 345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  41.48 
 
 		 350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04194  threonine aldolase  48.91 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0300  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  36.84 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  35.03 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  31.88 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  32.68 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  32.34 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  30.33 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  30.09 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  27.84 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  30.77 
 
 		 368 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  29.89 
 
 		 346 aa  149  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  29.53 
 
 		 353 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  30.24 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  31.64 
 
 		 362 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  29.41 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  30.47 
 
 		 346 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  28.57 
 
 		 352 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  29.41 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  30.03 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  28.07 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  29.14 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  28.27 
 
 		 375 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  26.25 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  28.16 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  27.33 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  29.88 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  27.91 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  30.34 
 
 		 358 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  30.34 
 
 		 358 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  28.2 
 
 		 350 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  30.34 
 
 		 358 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  28.49 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  28.49 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  28.24 
 
 		 346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  28 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  29.29 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  28.29 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  29.29 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  27.76 
 
 		 361 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  27.7 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  29.18 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  28.99 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  27.3 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  27.59 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  29.5 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  27.62 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  28.95 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  27.76 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  27.76 
 
 		 371 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  28.95 
 
 		 346 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  28.21 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  27.3 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  28.61 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  27.33 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  28.41 
 
 		 346 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  31 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  26.57 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  31 
 
 		 353 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  28.57 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  26.71 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  28.29 
 
 		 350 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  28.16 
 
 		 349 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  31.62 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  28.57 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  28.32 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  27.38 
 
 		 353 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  27.35 
 
 		 349 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  27.19 
 
 		 352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  29.11 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  25.57 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  26.11 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  27.35 
 
 		 364 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  27.75 
 
 		 345 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  29.23 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  29.17 
 
 		 348 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  25.14 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  27.6 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  26.38 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  27.98 
 
 		 345 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  28.45 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  26.65 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  26.11 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  27.81 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  25.54 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>