20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10297 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10297  transmembrane protein  100 
 
 		 472 aa  879    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000883477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0420  hypothetical protein  60.37 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0321  hypothetical protein  58.88 
 
 		 482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0388  hypothetical protein  59.96 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45366 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0379  hypothetical protein  60.31 
 
 		 459 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0367  hypothetical protein  59.96 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5967  hypothetical protein  41.86 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5564  hypothetical protein  41.86 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0944737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8100  hypothetical protein  36.23 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0081  hypothetical protein  30.08 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0282118  normal  0.0438022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13912  transmembrane protein  25.84 
 
 		 479 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000584195  normal  0.954546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1682  secretion protein snm4  23.54 
 
 		 515 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.655612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04370  secretion protein snm4  28.12 
 
 		 464 aa  50.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.435165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0864  secretion protein snm4  33.33 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.375848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0990  secretion protein snm4  29.08 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0265679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0764  hypothetical protein  29.13 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5431  protein of unknown function DUF571  29.36 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0073  hypothetical protein  29.85 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6572  secretion protein snm4  25.05 
 
 		 464 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1209  secretion protein snm4  28.81 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>