268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1832 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1832  dehydratase  100 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  38.82 
 
 
311 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0296  Enoyl-CoA hydratase  38.82 
 
 
153 aa  102  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1389  MaoC-like dehydratase  47.06 
 
 
154 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491643  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1474  Enoyl-CoA hydratase  40.43 
 
 
150 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118864  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3821  dehydratase  39.86 
 
 
151 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0839  MaoC domain protein dehydratase  41.78 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.952766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2194  MaoC domain protein dehydratase  38.41 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.302832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2139  MaoC-like dehydratase  41.01 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3810  dehydratase  43.06 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.511193  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5106  MaoC domain protein dehydratase  40.85 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2586  dehydratase  45.16 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.945813  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0635  MaoC-like dehydratase  39.72 
 
 
151 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1871  MaoC domain protein dehydratase  47 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.544936  normal  0.36 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0237  MaoC-like domain-containing protein  40.44 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0958  hypothetical protein  43.84 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0981  MaoC-like dehydratase  45.38 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0231  Enoyl-CoA hydratase  36 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.460096  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3837  MaoC-like dehydratase  41.86 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101084  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2745  dehydratase  42.86 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1240  MaoC-like dehydratase  46.67 
 
 
151 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0947  MaoC-like dehydratase  43.8 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2059  MaoC domain protein dehydratase  47.62 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.683628  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3655  MaoC domain protein dehydratase  38 
 
 
162 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0104771  normal  0.224277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10131  hypothetical protein  40.14 
 
 
151 aa  92  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1577  dehydratase  41.67 
 
 
154 aa  92  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0775031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2042  hypothetical protein  40.31 
 
 
162 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1676  MaoC-like dehydratase  38.03 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.633015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11910  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0480105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1094  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00316443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4135  dehydratase  43.85 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5486  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0873  dehydratase  47.52 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.942848  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1668  dehydratase  41.67 
 
 
194 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4641  MaoC domain protein dehydratase  44.35 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00972568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4982  MaoC-like dehydratase  39.57 
 
 
151 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4259  MaoC domain protein dehydratase  37.67 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.358063  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0126  enoyl-CoA hydratase  43.55 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.787557 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2267  dehydratase  38.56 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0438  dehydratase  47.66 
 
 
164 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.15838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3353  MaoC domain protein dehydratase  38 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4817  MaoC domain-containing protein  41.13 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0180  MaoC-like dehydratase  38.24 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000686309  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0734  MaoC-like domain protein  41.32 
 
 
151 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0917658  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3913  dehydratase  40.14 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.834878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1365  MaoC domain protein dehydratase  40.77 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146168  hitchhiker  0.00131877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1034  dehydratase  39.29 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248212  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4374  dehydratase  37.32 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2146  dehydratase  37.25 
 
 
158 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1649  dehydratase  35.53 
 
 
152 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195889  normal  0.818072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1152  hypothetical protein  40.14 
 
 
150 aa  87  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0649  dehydratase  42.06 
 
 
150 aa  87  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0604  dehydratase  40.31 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1346  dehydratase  38.51 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5146  putative oxidoreductase NodN-like protein  41.6 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.511512 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3764  dehydratase  38.71 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.51064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4397  Enoyl-CoA hydratase  36.73 
 
 
156 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.124915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1612  enoyl-CoA hydratase  40.71 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16780  acyl dehydratase  37.69 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5858  Enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4909  Enoyl-CoA hydratase  37.33 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3189  putative nodulation-related acyl dehydratase, MaoC/NodN-like  41.73 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4870  dehydratase  41.18 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1858  Enoyl-CoA hydratase  41.48 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1690  MaoC-like dehydratase  36.89 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1989  dehydratase  42.02 
 
 
158 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.720073  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2865  MaoC domain protein dehydratase  49.02 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4692  dehydratase  41.13 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3542  dehydratase  49.02 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249492  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2065  dehydratase  38.52 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4109  dehydratase  35.71 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202946  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3534  dehydratase  40.15 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0316427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5640  Enoyl-CoA hydratase  38.71 
 
 
151 aa  84.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4012  Enoyl-CoA hydratase  39.29 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4112  Enoyl-CoA hydratase  39.73 
 
 
161 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0069293  normal  0.0412818 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1310  MaoC domain-containing protein  42.02 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1809  MaoC family protein  42.02 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0345748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1456  MaoC-like domain-containing protein  42.02 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2253  dehydratase  36.84 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.608983  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0717  MaoC family protein  42.02 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1150  MaoC family protein  42.02 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0292  Enoyl-CoA hydratase  37.67 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000103389  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1617  MaoC-like dehydratase  36.84 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2479  MaoC domain protein dehydratase  40.16 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0433  MaoC family protein  42.02 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2229  dehydratase  36.84 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0758  Enoyl-CoA hydratase  35.66 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01750  Acyl dehydratase  40.16 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2724  Enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0179226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4903  MaoC domain protein dehydratase  39.71 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0134263  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3206  MaoC-like dehydratase  38.58 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5029  MaoC domain protein dehydratase  39.02 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3008  dehydratase  37.7 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026488  normal  0.774607 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1319  MaoC domain-containing protein  41.18 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.745158  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0497  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.628892  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2249  MaoC-like dehydratase  40.16 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135818 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2402  MaoC-like dehydratase  40.68 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1081  MaoC family protein  42.86 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3635  dehydratase  39.06 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7557  MaoC-like dehydratase  37.32 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0846  dehydratase  37.32 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>