More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0328 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0328  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  78.45 
 
 		 116 aa  184  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  76.72 
 
 		 117 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 118 aa  179  8.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 117 aa  177  4e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 117 aa  177  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  74.14 
 
 		 117 aa  176  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  75 
 
 		 118 aa  174  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1007  50S ribosomal protein L17  73.2 
 
 		 99 aa  145  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.168469  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1750  50S ribosomal protein L17  72.16 
 
 		 99 aa  142  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00132391  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  55.2 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  50 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  53.85 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  52.14 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  50 
 
 		 131 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  116  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  52.99 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  49.17 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  54.31 
 
 		 117 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  49.14 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2143  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  0.318394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  49.14 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  50.45 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  47.41 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 127 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 138 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 133 aa  113  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3922  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  52.14 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  51.28 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>