More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0072 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0072  undecaprenol kinase  100 
 
 
256 aa  491  1e-138  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2029  undecaprenol kinase  63.92 
 
 
255 aa  331  8e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3328  putative undecaprenol kinase  60.41 
 
 
254 aa  301  8e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1816  undecaprenol kinase, putative  55.29 
 
 
255 aa  291  8e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1371  putative undecaprenol kinase  50.2 
 
 
255 aa  264  1e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0409188  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1235  undecaprenol kinase, putative  50 
 
 
258 aa  235  6e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3622  putative undecaprenol kinase  46.85 
 
 
254 aa  220  2e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0437  putative undecaprenol kinase  48.21 
 
 
258 aa  219  3e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.222159  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0215  putative undecaprenol kinase  48.59 
 
 
267 aa  215  6e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0198  undecaprenol kinase, putative  48.59 
 
 
267 aa  214  1e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0237  undecaprenol kinase, putative  48.59 
 
 
267 aa  214  1e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1667  undecaprenol kinase  42.58 
 
 
254 aa  211  8e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0027  undecaprenol kinase, putative  47.41 
 
 
268 aa  210  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  42.86 
 
 
252 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  9.43331e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1321  undecaprenol kinase  44.75 
 
 
252 aa  201  9e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2692  undecaprenyl-diphosphatase  42.31 
 
 
276 aa  195  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1864  undecaprenol kinase  42.8 
 
 
266 aa  195  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.114213  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1245  undecaprenol kinase  44.53 
 
 
258 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.58 
 
 
274 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3911  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.51 
 
 
274 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971471  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0452  undecaprenol kinase  39 
 
 
258 aa  191  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.825456  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4278  putative undecaprenol kinase  41.02 
 
 
306 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  3.18908e-06  normal  0.0359854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3591  putative undecaprenol kinase  41.09 
 
 
286 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.11 
 
 
280 aa  189  5e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2919  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41 
 
 
276 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151391  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.15 
 
 
277 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.49 
 
 
284 aa  186  4e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  5.83007e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0481  undecaprenol kinase  39.08 
 
 
267 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1408  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 
269 aa  185  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.03456e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2175  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.09 
 
 
276 aa  185  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0169688 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.96 
 
 
272 aa  184  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.7 
 
 
283 aa  184  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  1.34855e-09 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1983  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.37 
 
 
280 aa  184  1e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554985  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0666  undecaprenol kinase, putative  40.54 
 
 
273 aa  184  1e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.15 
 
 
277 aa  184  1e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0949  undecaprenyl-diphosphatase  44.76 
 
 
263 aa  184  2e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.497251  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2862  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.61 
 
 
277 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2286  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.65 
 
 
273 aa  182  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41 
 
 
277 aa  182  5e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1803  undecaprenyl-diphosphatase  40.77 
 
 
274 aa  182  5e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1120  putative undecaprenol kinase  40.3 
 
 
268 aa  181  9e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.8331  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2827  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.23 
 
 
276 aa  181  9e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3618  undecaprenol kinase  40.75 
 
 
266 aa  181  9e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.359359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3337  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.6 
 
 
277 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2527  undecaprenyl-diphosphatase  40.53 
 
 
269 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2602  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.51 
 
 
276 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.273889  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.58 
 
 
267 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0259  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.98 
 
 
303 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.560106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2756  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
276 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0660  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.22 
 
 
266 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484694  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39190  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
277 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708152  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28720  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.3 
 
 
277 aa  179  3e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1257  undecaprenol kinase  42.47 
 
 
266 aa  179  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0873  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.78 
 
 
278 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.528066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.77 
 
 
274 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0701  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.71 
 
 
293 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0205173  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0805  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.46 
 
 
276 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.838445  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.99 
 
 
293 aa  178  6e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.93 
 
 
278 aa  178  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0887  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.02 
 
 
276 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.521518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.02 
 
 
276 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0621374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3600  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.38 
 
 
268 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0848  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
278 aa  177  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0285  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.13 
 
 
281 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.782685  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0917  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.02 
 
 
276 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0610  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
293 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00505052  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0757  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.13 
 
 
293 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
275 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.22 
 
 
293 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0689284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0788  undecaprenol kinase  39.7 
 
 
281 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.878199  normal  0.592274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.91 
 
 
277 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3008  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.16 
 
 
276 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112856  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3141  undecaprenol kinase, putative  39.25 
 
 
276 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0312713  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0794  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.46 
 
 
276 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.31 
 
 
270 aa  174  1e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2184  Undecaprenyl-diphosphatase  37.92 
 
 
269 aa  174  1e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0234  undecaprenol kinase  37.32 
 
 
293 aa  173  3e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0438  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.54 
 
 
268 aa  173  3e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0882  undecaprenol kinase  39.62 
 
 
259 aa  172  4e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0045  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.54 
 
 
268 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1538  undecaprenol kinase, putative  38.35 
 
 
280 aa  171  8e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.634552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.23 
 
 
278 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.17 
 
 
272 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00333186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4021  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.02 
 
 
276 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.597407 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5424  undecaprenol kinase  38.34 
 
 
267 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0184  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 
268 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2474  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 
276 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0165  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.93 
 
 
268 aa  170  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1051  undecaprenol kinase, putative  38.31 
 
 
274 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.566548  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.82 
 
 
274 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.7 
 
 
274 aa  168  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.64 
 
 
272 aa  168  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.27 
 
 
273 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 
274 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0254  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.53 
 
 
265 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.93 
 
 
274 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.27 
 
 
272 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0395  undecaprenol kinase  36.43 
 
 
256 aa  166  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0363405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.26 
 
 
268 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16350  Undecaprenyl-diphosphatase  37.25 
 
 
314 aa  166  3e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0173909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>