More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4309 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4309  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
190 aa  378  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4745  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  98.95 
 
 
190 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.587694  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0834  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68.45 
 
 
195 aa  236  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258272  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.13 
 
 
182 aa  228  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0615  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.61 
 
 
195 aa  228  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.78 
 
 
180 aa  227  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.24 
 
 
184 aa  227  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.09 
 
 
222 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.8 
 
 
184 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.22 
 
 
189 aa  222  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.67 
 
 
183 aa  221  4e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.67 
 
 
184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.48 
 
 
224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0556  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.98 
 
 
188 aa  218  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600381  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.89 
 
 
190 aa  216  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.56 
 
 
183 aa  216  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.98 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.56 
 
 
183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.67 
 
 
183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35700  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68.11 
 
 
184 aa  215  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.175987  normal  0.670419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  58.79 
 
 
183 aa  215  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.57 
 
 
182 aa  211  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  59.78 
 
 
184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.53 
 
 
183 aa  209  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  66.85 
 
 
608 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5377  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.44 
 
 
194 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1412  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.59 
 
 
191 aa  207  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.98 
 
 
180 aa  204  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8427  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
179 aa  204  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2897  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 
180 aa  202  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.3 
 
 
183 aa  198  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5161  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.11 
 
 
211 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4775  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.11 
 
 
211 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4861  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  60.11 
 
 
211 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196918  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
181 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
183 aa  194  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
183 aa  192  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0203  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  61.8 
 
 
184 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.727257  normal  0.158525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
179 aa  191  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
189 aa  190  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4313  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.64 
 
 
595 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 
186 aa  188  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02020  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
199 aa  187  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.63 
 
 
176 aa  187  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13655  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 
216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0149578  hitchhiker  0.000159475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
180 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.37 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.27 
 
 
180 aa  180  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0107  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.67 
 
 
182 aa  179  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.576089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.07 
 
 
676 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
181 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1847  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  53.07 
 
 
187 aa  179  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3028  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
180 aa  176  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.96 
 
 
682 aa  176  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  47.54 
 
 
180 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
178 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.46 
 
 
181 aa  174  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.1 
 
 
190 aa  171  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  48.63 
 
 
180 aa  169  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
181 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
179 aa  167  6e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00021639  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.16 
 
 
186 aa  167  6e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
174 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.33 
 
 
181 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0641  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
177 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.801586  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
175 aa  161  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
181 aa  161  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0623  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45 
 
 
189 aa  160  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 
178 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
181 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
181 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
178 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0886  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
182 aa  157  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000644191  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
178 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
177 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
178 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
178 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
178 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
178 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0063  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.09 
 
 
181 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000259815  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3004  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
178 aa  155  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2752  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
176 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.567949  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
182 aa  155  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
182 aa  155  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
178 aa  154  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
178 aa  154  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
178 aa  154  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>