40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1617 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1617  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  258  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000562608  decreased coverage  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3038  hypothetical protein  74.8 
 
 		 128 aa  206  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000260642  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2437  hypothetical protein  73.39 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000639887  hitchhiker  0.000966367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2772  hypothetical protein  66.67 
 
 		 128 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2471  hypothetical protein  69.35 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000395628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1586  hypothetical protein  66.67 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000390951  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2792  hypothetical protein  66.67 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000962258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2867  hypothetical protein  66.67 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121266  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1461  hypothetical protein  66.94 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000145947  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1449  hypothetical protein  66.13 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  unclonable  0.0000000000491458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1396  hypothetical protein  64.52 
 
 		 128 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000125062  unclonable  0.0000000000128265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2179  hypothetical protein  65.08 
 
 		 125 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000382039  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3100  hypothetical protein  62.2 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1042  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.6 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.2 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3411  hypothetical protein  46.46 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111796  normal  0.118068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6298  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.5 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1459  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  41.13 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2822  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.21 
 
 		 136 aa  104  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0875651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1060  hypothetical protein  39.84 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0670433  normal  0.188198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03735  glyoxalase  38.21 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494145  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2769  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0588  hypothetical protein  40.32 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2166  lactoylglutathione lyase  34.68 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4341  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.4 
 
 		 141 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0402058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6151  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.71 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606403  normal  0.343074 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4457  hypothetical protein  35.94 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.720982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0606  glyoxalase family protein  37.3 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.114771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.68 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.379546  normal  0.0722466 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2749  hypothetical protein  37.88 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.495938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2245  glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase family protein  31.15 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589372  hitchhiker  0.000106854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3030  hypothetical protein  28.33 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3141  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3203  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.397338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.87 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0387  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0103253  normal  0.0182222 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0673  hypothetical protein  31.43 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.86 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  0.355506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>