69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3994 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  284  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  56.12 
 
 
143 aa  153  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  36.62 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  36.62 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  36.62 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  36.62 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  36.62 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  36.62 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  36.62 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  36.62 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  38.85 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  37.14 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5705  hypothetical protein  40.43 
 
 
138 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6069  hypothetical protein  40.43 
 
 
138 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.724335 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6553  hypothetical protein  39.72 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  31.21 
 
 
144 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  44.04 
 
 
144 aa  82  3e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  38.69 
 
 
135 aa  78.6  2e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3414  hypothetical protein  34.56 
 
 
138 aa  77.8  4e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00102667  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  77.8  5e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3117  hypothetical protein  34.56 
 
 
138 aa  77.4  6e-14  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1831  XoxI  34.81 
 
 
138 aa  76.6  9e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  3.6824e-06  normal  0.167338 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3430  hypothetical protein  33.82 
 
 
138 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3521  hypothetical protein  35.21 
 
 
136 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3211  hypothetical protein  33.82 
 
 
138 aa  74.7  4e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3464  hypothetical protein  33.82 
 
 
138 aa  74.7  4e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.21504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3189  hypothetical protein  33.82 
 
 
138 aa  74.7  4e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1085  hypothetical protein  32.82 
 
 
161 aa  73.9  7e-13  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3426  hypothetical protein  33.82 
 
 
138 aa  73.9  7e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0586777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3442  hypothetical protein  34.11 
 
 
138 aa  72.4  2e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5078  hypothetical protein  32.12 
 
 
138 aa  70.9  5e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4716  hypothetical protein  32.12 
 
 
138 aa  70.9  5e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1056  hypothetical protein  26.47 
 
 
145 aa  68.2  3e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0967482  normal  0.03281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0601  hypothetical protein  26.47 
 
 
145 aa  68.2  3e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0427524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0540  hypothetical protein  26.47 
 
 
145 aa  68.2  3e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2544  hypothetical protein  38.69 
 
 
157 aa  67.8  4e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2543  hypothetical protein  32.84 
 
 
158 aa  68.2  4e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1028  hypothetical protein  34.4 
 
 
157 aa  66.2  2e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2419  MxaD protein  32.56 
 
 
168 aa  63.5  1e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0515899  normal  0.905694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0938  hypothetical protein  30.83 
 
 
168 aa  62.4  2e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.265623  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2160  hypothetical protein  30.99 
 
 
181 aa  62.8  2e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  25.97 
 
 
176 aa  60.8  5e-09  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0826  hypothetical protein  35.54 
 
 
141 aa  60.8  7e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.229535  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0939  hypothetical protein  29.32 
 
 
166 aa  60.5  7e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0127  hypothetical protein  30.66 
 
 
157 aa  60.1  9e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  0.0306658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1659  MxaD protein  27.88 
 
 
162 aa  59.7  1e-08  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.332339  normal  0.0308895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1923  hypothetical protein  33.87 
 
 
159 aa  59.3  2e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3046  MxaD protein  30.28 
 
 
181 aa  56.2  1e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3357  hypothetical protein  31.01 
 
 
164 aa  56.2  1e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  31.76 
 
 
177 aa  55.1  3e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2981  hypothetical protein  27.94 
 
 
149 aa  54.3  5e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0030  hypothetical protein  28.47 
 
 
178 aa  54.3  6e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  0.937966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3114  MxaD protein  31.25 
 
 
178 aa  51.6  4e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16740  hypothetical protein  33.58 
 
 
138 aa  51.2  5e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0136684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1581  hypothetical protein  29.17 
 
 
152 aa  49.7  1e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0102  hypothetical protein  28.26 
 
 
142 aa  49.3  2e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0195  hypothetical protein  26 
 
 
183 aa  48.9  2e-05  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32187 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3014  MxaD protein  30.28 
 
 
173 aa  49.3  2e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872014  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4385  hypothetical protein  27.08 
 
 
187 aa  48.9  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190463  normal  0.207076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2381  MxaD gene product  27.46 
 
 
175 aa  48.1  3e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.1214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5323  putative signal peptide  26.42 
 
 
179 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.168368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  32.69 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0481  MxaD protein, putative  30 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4140  MxaD protein, putative  28.7 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809932  normal  0.962091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4622  MxaD protein, putative  30.28 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886356  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4508  MxaD protein, putative  29.2 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  23.2 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0789  cyclase/dehydrase  26.72 
 
 
186 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0789  MxaD protein, putative  25.52 
 
 
174 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.28208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>