23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1923 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1923  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  331  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2463  hypothetical protein  34.04 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00011136  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1841  Polyketide cyclase/dehydrase  35.38 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0882  hypothetical protein  32.23 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.479556  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1657  hypothetical protein  32.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0756  hypothetical protein  32.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.299244  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2010  hypothetical protein  32.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132855  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2105  hypothetical protein  32.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0702  hypothetical protein  32.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0592  hypothetical protein  32.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0519  hypothetical protein  32.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4813  hypothetical protein  35.66 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4812  hypothetical protein  32.21 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4407  hypothetical protein  32.28 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3994  hypothetical protein  33.87 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0672627  normal  0.158861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1029  hypothetical protein  28.1 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  0.0601496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1581  hypothetical protein  26.58 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0540  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1056  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0967482  normal  0.03281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0601  hypothetical protein  29.41 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0427524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0625  hypothetical protein  27.74 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2028  hypothetical protein  25.49 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2761  hypothetical protein  24.5 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.264134  normal  0.221278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>