18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0167 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0167  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1266    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2814  hypothetical protein  29.17 
 
 		 586 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4885  hypothetical protein  27.57 
 
 		 617 aa  124  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.925702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2617  hypothetical protein  27.05 
 
 		 623 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  24.55 
 
 		 602 aa  93.2  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2254  hypothetical protein  28.06 
 
 		 606 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.706828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4143  hypothetical protein  25.98 
 
 		 594 aa  84.7  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0804  hypothetical protein  25.65 
 
 		 613 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4230  hypothetical protein  27.84 
 
 		 600 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3930  hypothetical protein  26.87 
 
 		 595 aa  73.9  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  25.36 
 
 		 579 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7365  hypothetical protein  23.21 
 
 		 599 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  25.41 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  25.41 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  25.41 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5288  hypothetical protein  25.21 
 
 		 574 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4578  hypothetical protein  25.21 
 
 		 574 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  30.11 
 
 		 552 aa  48.5  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>