288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2299 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2251  heat shock protein 90  97.8 
 
 
637 aa  1295  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.11928e-07  normal  0.266626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0564  heat shock protein 90  69.13 
 
 
624 aa  897  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0215188  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0814  heat shock protein 90  63.29 
 
 
632 aa  835  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  58.04 
 
 
629 aa  778  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3161  heat shock protein 90  55.24 
 
 
625 aa  700  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0144125 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0859  heat shock protein 90  58.43 
 
 
632 aa  767  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0532  heat shock protein 90  68.35 
 
 
624 aa  890  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0532  heat shock protein 90  68.5 
 
 
624 aa  891  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0296  heat shock protein 90  58.39 
 
 
636 aa  775  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2548  heat shock protein 90  95.76 
 
 
637 aa  1273  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00763476  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1158  heat shock protein 90  58.43 
 
 
632 aa  767  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.789148  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1167  heat shock protein 90  58.27 
 
 
632 aa  766  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.943574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0289  heat shock protein 90  58.43 
 
 
632 aa  767  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2232  heat shock protein 90  84.35 
 
 
639 aa  1119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  1.00055e-05  hitchhiker  0.000273756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01104  heat shock protein 90  70.57 
 
 
640 aa  932  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0548  heat shock protein 90  68.5 
 
 
624 aa  891  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0592  heat shock protein 90  68.66 
 
 
624 aa  893  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  53.41 
 
 
633 aa  711  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0484  heat shock protein 90  53.74 
 
 
662 aa  690  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1005  heat shock protein 90  58.43 
 
 
632 aa  767  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.406773  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2323  heat shock protein 90  97.65 
 
 
637 aa  1293  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.23215e-05  hitchhiker  0.000689405 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  54.83 
 
 
652 aa  736  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1538  heat shock protein 90  84.77 
 
 
637 aa  1117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0309955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2383  heat shock protein 90  58.74 
 
 
632 aa  754  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43850  heat shock protein 90  58.7 
 
 
634 aa  782  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2347  heat shock protein 90  59.06 
 
 
632 aa  763  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.75134  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1694  heat shock protein 90  53.61 
 
 
642 aa  716  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000812409  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2443  heat shock protein 90  97.96 
 
 
637 aa  1294  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.25948e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1798  heat shock protein 90  95.92 
 
 
637 aa  1276  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.45006e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1313  heat shock protein 90  85.53 
 
 
637 aa  1150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.133282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0956  heat shock protein 90  64.98 
 
 
634 aa  867  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.538924  normal  0.713469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1054  heat shock protein 90  62.03 
 
 
630 aa  812  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.374422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1372  heat shock protein 90  55.96 
 
 
647 aa  736  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4289  heat shock protein 90  56.3 
 
 
668 aa  722  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3587  heat shock protein 90  54.17 
 
 
629 aa  702  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0475  heat shock protein 90  55.06 
 
 
650 aa  705  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0953677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0538  heat shock protein 90  68.5 
 
 
624 aa  891  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.132733  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  66.93 
 
 
624 aa  875  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1138  heat shock protein 90  64.67 
 
 
623 aa  829  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145495  unclonable  3.82364e-08 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2113  heat shock protein 90  59.06 
 
 
630 aa  775  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0266  heat shock protein 90  58.54 
 
 
636 aa  776  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.48191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2263  heat shock protein 90  59.21 
 
 
632 aa  765  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0551  heat shock protein 90  54.6 
 
 
634 aa  696  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2368  heat shock protein 90  59.06 
 
 
632 aa  762  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231362  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2663  heat shock protein 90  95.6 
 
 
637 aa  1271  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0275177  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1796  heat shock protein 90  83.7 
 
 
638 aa  1112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.4656e-05  unclonable  1.64624e-08 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1175  heat shock protein 90  54.92 
 
 
650 aa  693  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0932  heat shock protein 90  59.37 
 
 
632 aa  765  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.294237  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  58.48 
 
 
633 aa  756  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.47765e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2893  heat shock protein 90  66.77 
 
 
624 aa  868  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.661781  normal  0.181179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3750  heat shock protein 90  59.34 
 
 
634 aa  799  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3195  heat shock protein 90  66.77 
 
 
624 aa  868  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3143  heat shock protein 90  69.13 
 
 
624 aa  897  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00327164  normal  0.0320085 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0516  heat shock protein 90  69.13 
 
 
624 aa  897  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117874  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2849  heat shock protein 90  83.39 
 
 
638 aa  1113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.20054e-06  decreased coverage  5.18986e-09 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0511  heat shock protein 90  68.98 
 
 
624 aa  895  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00679401  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0550  heat shock protein 90  69.13 
 
 
624 aa  897  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0208648  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2299  heat shock protein 90  100 
 
 
637 aa  1316  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  3.23275e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2491  heat shock protein 90  59.65 
 
 
634 aa  790  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222444  normal  0.0870185 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1548  heat shock protein 90  58.7 
 
 
630 aa  776  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00180815  normal  0.134338 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0506  heat shock protein 90  64.66 
 
 
635 aa  835  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1689  heat shock protein 90  59.18 
 
 
634 aa  798  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.05546  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00313  heat shock protein 90  58.45 
 
 
634 aa  769  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0580  heat shock protein 90  53.5 
 
 
653 aa  696  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.360532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2370  heat shock protein 90  61.26 
 
 
642 aa  796  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0508031  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3678  heat shock protein 90  57.91 
 
 
634 aa  772  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0851  heat shock protein 90  56.72 
 
 
643 aa  749  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415809  normal  0.667015 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2586  heat shock protein 90  95.6 
 
 
637 aa  1271  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  8.2742e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3055  heat shock protein 90  66.77 
 
 
622 aa  867  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1216  heat shock protein 90  59.37 
 
 
632 aa  772  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  58.16 
 
 
633 aa  755  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  1.71528e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0405  heat shock protein 90  68.98 
 
 
624 aa  894  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.103102  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01327  heat shock protein 90  64.39 
 
 
634 aa  828  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3502  heat shock protein 90  59.49 
 
 
634 aa  801  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.791518  normal  0.824555 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  58.04 
 
 
629 aa  778  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00424  heat shock protein 90  69.13 
 
 
624 aa  897  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.318011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2342  heat shock protein 90  57.46 
 
 
633 aa  735  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1078  heat shock protein 90  61.65 
 
 
633 aa  817  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0117405  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1318  heat shock protein 90  58.43 
 
 
632 aa  767  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.443077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1718  heat shock protein 90  59.87 
 
 
634 aa  795  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1625  heat shock protein 90  58.07 
 
 
634 aa  775  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3232  heat shock protein 90  65.78 
 
 
629 aa  860  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0881904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5686  heat shock protein 90  58.9 
 
 
632 aa  760  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  57.48 
 
 
630 aa  748  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1079  heat shock protein 90  65.93 
 
 
629 aa  862  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0217188  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2002  Heat shock protein Hsp90-like protein  58.93 
 
 
626 aa  754  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000463529  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3036  heat shock protein 90  66.25 
 
 
629 aa  868  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00429  hypothetical protein  69.13 
 
 
624 aa  897  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.304335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1109  heat shock protein 90  58.33 
 
 
639 aa  743  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004137  chaperone protein HtpG  65.66 
 
 
634 aa  838  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1526  heat shock protein 90  84.95 
 
 
638 aa  1127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178213  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1719  heat shock protein 90  52.34 
 
 
656 aa  685  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3137  heat shock protein Hsp90  69.13 
 
 
624 aa  897  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4179  heat shock protein 90  59.34 
 
 
634 aa  800  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.745481  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  52.28 
 
 
640 aa  688  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0848  heat shock protein 90  59.55 
 
 
634 aa  766  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.846275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0990  heat shock protein 90  56.72 
 
 
640 aa  743  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0890084  normal  0.343937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3901  heat shock protein 90  63.62 
 
 
653 aa  869  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.795746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2016  heat shock protein 90  97.96 
 
 
637 aa  1296  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  59.34 
 
 
635 aa  796  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>