37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4813 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4813  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.910755  hitchhiker  0.000170141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  48.57 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  48.57 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  48.57 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  48.57 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  48.1 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  49.05 
 
 		 222 aa  211  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  49.05 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  49.05 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  49.05 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  49.05 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  49.05 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  49.05 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  49.05 
 
 		 222 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  42.25 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  38.16 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  39.15 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  37.5 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  37.96 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  37.8 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  38.66 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  37.63 
 
 		 273 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  38.14 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  35.44 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  37 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  33.51 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  28.29 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  25.95 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  24.69 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  25.71 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  23.2 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  24.57 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  23.75 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  23.83 
 
 		 226 aa  42  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>