More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3998 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3998  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
178 aa  358  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3479  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  93.26 
 
 
181 aa  337  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3351  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  93.26 
 
 
181 aa  337  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00328622  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1019  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  92.7 
 
 
181 aa  335  3e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0673  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  89.89 
 
 
178 aa  328  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.959091  normal  0.12012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0202  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  90.45 
 
 
178 aa  327  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  90.45 
 
 
178 aa  327  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.186171  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0189  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  90.45 
 
 
178 aa  327  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00123  hypothetical protein  88.76 
 
 
178 aa  325  1e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0129  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  88.76 
 
 
178 aa  325  1e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.49178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0118  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  88.76 
 
 
178 aa  325  1e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0194  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  89.89 
 
 
178 aa  326  1e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.99214  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0133  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  88.76 
 
 
178 aa  325  1e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00124  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  88.76 
 
 
178 aa  325  1e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0185  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  89.89 
 
 
178 aa  326  1e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0734521  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  88.76 
 
 
178 aa  325  1e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3477  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  88.76 
 
 
182 aa  325  2e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3534  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  88.76 
 
 
182 aa  325  2e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0135  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  88.76 
 
 
178 aa  324  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1154  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  89.08 
 
 
178 aa  316  9e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  87.93 
 
 
177 aa  316  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.472087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3124  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  88.51 
 
 
178 aa  315  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1022  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  85.8 
 
 
177 aa  292  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03458  hypothetical protein  78.74 
 
 
176 aa  283  6e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0117  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  76.97 
 
 
177 aa  278  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002554  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  75.45 
 
 
169 aa  266  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1752  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  71.26 
 
 
176 aa  264  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00124544  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2618  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  72.41 
 
 
176 aa  262  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3142  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  65.54 
 
 
176 aa  242  2e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0463  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  68.57 
 
 
179 aa  242  2e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.43113e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3910  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.37 
 
 
176 aa  241  4e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.835811  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0793  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.28 
 
 
176 aa  239  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3818  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.28 
 
 
176 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0822  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.28 
 
 
176 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.28 
 
 
176 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0688  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.04 
 
 
177 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3233  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  64.41 
 
 
176 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3803  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.71 
 
 
176 aa  236  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3713  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.71 
 
 
190 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0654  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.28 
 
 
176 aa  235  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.306745  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3590  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.71 
 
 
176 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0169693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3521  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.71 
 
 
176 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241179  hitchhiker  0.00357405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0721  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.71 
 
 
176 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.59238  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0829  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  62.15 
 
 
176 aa  234  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0771  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  63.22 
 
 
176 aa  230  7e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0512  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.69 
 
 
187 aa  210  7e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
176 aa  210  8e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0329  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.67 
 
 
178 aa  207  9e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
186 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684921  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
179 aa  200  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1428  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
181 aa  200  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0375844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2786  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
181 aa  200  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0223963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2230  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
179 aa  200  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.97 
 
 
180 aa  198  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
176 aa  194  5e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1368  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
180 aa  193  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282504  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1581  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.11 
 
 
178 aa  191  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.435118  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
174 aa  191  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  5.69861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
181 aa  190  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2046  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
184 aa  187  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
181 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  7.42772e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
176 aa  186  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
189 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
175 aa  184  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
189 aa  184  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
175 aa  184  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
175 aa  184  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
175 aa  184  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
175 aa  184  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
175 aa  184  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
183 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
183 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
175 aa  184  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
182 aa  183  1e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
175 aa  183  1e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3435  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
188 aa  182  2e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121685  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
182 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.7 
 
 
190 aa  181  5e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
176 aa  181  5e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
179 aa  180  9e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00021639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
175 aa  180  9e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  179  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1412  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
191 aa  179  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5055 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
179 aa  179  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
181 aa  179  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
186 aa  178  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5377  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
194 aa  178  5e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013711 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0623  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
189 aa  177  6e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
183 aa  177  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35700  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
184 aa  177  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.175987  normal  0.670419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
184 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
183 aa  176  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4775  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
211 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5161  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
211 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.571818  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1437  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
181 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.55755e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.94 
 
 
184 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4861  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
211 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196918  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0641  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
177 aa  175  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.801586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0723  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 
178 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293167  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
184 aa  175  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>