30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3913 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3913  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1091 aa  2214    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.49 
 
 		 1489 aa  78.6  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25.97 
 
 		 1066 aa  68.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  25.82 
 
 		 994 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  24.85 
 
 		 1129 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  24.85 
 
 		 1131 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  24.33 
 
 		 1131 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  24.04 
 
 		 1131 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  24.85 
 
 		 1131 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  24.85 
 
 		 1131 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  24.33 
 
 		 1129 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.2 
 
 		 1125 aa  62.4  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  25.44 
 
 		 1130 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  22.94 
 
 		 1769 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  25.05 
 
 		 1004 aa  59.7  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  24.38 
 
 		 985 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 1033 aa  58.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  27.2 
 
 		 2848 aa  55.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  27.81 
 
 		 1011 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.51 
 
 		 1322 aa  54.3  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  21.87 
 
 		 1369 aa  53.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  26.86 
 
 		 998 aa  52.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  25.24 
 
 		 990 aa  51.2  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  24.25 
 
 		 986 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  24.15 
 
 		 972 aa  48.5  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  23.41 
 
 		 942 aa  48.5  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  22.71 
 
 		 1119 aa  47.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2198  hypothetical protein  29.7 
 
 		 342 aa  47.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000179032  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  24.31 
 
 		 1550 aa  45.8  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  23.32 
 
 		 995 aa  45.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>