30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3913 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3913  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1091 aa  2214  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.49 
 
 
1489 aa  78.6  7e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25.97 
 
 
1066 aa  68.9  4e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.07412e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  25.82 
 
 
994 aa  64.3  1e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  24.85 
 
 
1131 aa  63.9  2e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  24.33 
 
 
1131 aa  63.5  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  24.04 
 
 
1131 aa  63.2  2e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  24.85 
 
 
1131 aa  63.9  2e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  24.85 
 
 
1131 aa  63.9  2e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  24.85 
 
 
1129 aa  63.5  2e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  24.33 
 
 
1129 aa  63.5  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.2 
 
 
1125 aa  62.4  5e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  25.44 
 
 
1130 aa  60.8  1e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  22.94 
 
 
1769 aa  60.8  1e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  25.05 
 
 
1004 aa  59.7  3e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  24.38 
 
 
985 aa  59.7  3e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  25 
 
 
1033 aa  58.5  6e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  27.2 
 
 
2848 aa  55.5  6e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  27.81 
 
 
1011 aa  53.9  1e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.51 
 
 
1322 aa  54.3  1e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  6.38249e-09 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  21.87 
 
 
1369 aa  53.1  2e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  26.86 
 
 
998 aa  52.4  5e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  25.24 
 
 
990 aa  51.2  9e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  24.25 
 
 
986 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  24.15 
 
 
972 aa  48.5  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  23.41 
 
 
942 aa  48.5  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2198  hypothetical protein  29.7 
 
 
342 aa  47.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  1.79032e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  22.71 
 
 
1119 aa  47.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  24.31 
 
 
1550 aa  45.8  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  23.32 
 
 
995 aa  45.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>