57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2834 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  228  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  62.5 
 
 
116 aa  136  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  61.74 
 
 
119 aa  133  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  63.73 
 
 
116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  53.7 
 
 
119 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  54.72 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  54.24 
 
 
123 aa  118  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  51.72 
 
 
123 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  57.84 
 
 
120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  56.14 
 
 
117 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  56.38 
 
 
116 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  52.88 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  59.62 
 
 
120 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  52.94 
 
 
117 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  49.57 
 
 
120 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1871  hypothetical protein  63.73 
 
 
118 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.33795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  53.7 
 
 
129 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0584  protein of unknown function DUF1304  55.88 
 
 
120 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3402  hypothetical protein  45.83 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1841  hypothetical protein  45.83 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.995737 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  50.94 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  50.94 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  48.6 
 
 
120 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3957  protein of unknown function DUF1304  43.59 
 
 
120 aa  90.5  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  49.52 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  49.52 
 
 
120 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1160  hypothetical protein  44.14 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0975  hypothetical protein  44.14 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0989  hypothetical protein  44.14 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1059  hypothetical protein  44.14 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1143  hypothetical protein  44.14 
 
 
123 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1223  hypothetical protein  43.24 
 
 
123 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0977  hypothetical protein  43.24 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47495  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1910  hypothetical protein  44.66 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.724765  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  42.37 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1971  hypothetical protein  33.62 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000233421  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1034  hypothetical protein  32.69 
 
 
113 aa  61.6  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0608505  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  51.85 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  53.06 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  46.67 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  55.32 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1561  hypothetical protein  30.83 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  33.96 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  36.15 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  56.82 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1666  hypothetical protein  35.71 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08980  predicted membrane protein  35.96 
 
 
120 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.482637 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1637  hypothetical protein  34.82 
 
 
143 aa  48.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0253  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  41.18 
 
 
127 aa  47  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  31.82 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1508  hypothetical protein  36.61 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0455  hypothetical protein  26.02 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.720124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0443  hypothetical protein  26.02 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0949  hypothetical protein  36.23 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.996626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  42.86 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  35.48 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3138  hypothetical protein  53.12 
 
 
46 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.960037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>