More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2883 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2883  uridylate kinase  100 
 
 
242 aa  491  1e-138  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  9.41193e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  96.27 
 
 
245 aa  478  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  95.44 
 
 
245 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  93.78 
 
 
247 aa  468  1e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.96495e-07  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  92.53 
 
 
242 aa  464  1e-130  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.78948e-08  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  92.95 
 
 
242 aa  466  1e-130  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  92.53 
 
 
242 aa  465  1e-130  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.76881e-07  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  92.12 
 
 
245 aa  464  1e-130  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.593e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  92.53 
 
 
242 aa  465  1e-130  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  1.57467e-05  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  91.7 
 
 
245 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  6.89746e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  91.7 
 
 
245 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.03165e-05  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  92.5 
 
 
243 aa  461  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.49994e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  91.7 
 
 
245 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.25029e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  91.7 
 
 
245 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  8.85565e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  91.29 
 
 
245 aa  458  1e-128  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  91.25 
 
 
241 aa  452  1e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  9.22759e-08  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  81.25 
 
 
243 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  82.01 
 
 
241 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  82.01 
 
 
241 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.6823e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  81.59 
 
 
241 aa  411  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  83.26 
 
 
247 aa  411  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  81.25 
 
 
241 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3358  uridylate kinase  80 
 
 
241 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  80.83 
 
 
241 aa  407  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2979  uridylate kinase  80.83 
 
 
243 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1555  uridylate kinase  82.01 
 
 
247 aa  409  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  79.5 
 
 
241 aa  404  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.432338 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  79.92 
 
 
241 aa  404  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1849  uridylate kinase  82.23 
 
 
243 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.42917e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2425  uridylate kinase  80.91 
 
 
243 aa  390  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000236228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03235  uridylate kinase  82.16 
 
 
243 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002748  uridylate kinase  82.01 
 
 
241 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  5.03391e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2974  uridylate kinase  77.5 
 
 
249 aa  388  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0987  uridylate kinase  73.93 
 
 
238 aa  337  1e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  3.85538e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1274  uridylate kinase  64.58 
 
 
240 aa  327  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000592855  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  65.69 
 
 
242 aa  325  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  64.44 
 
 
247 aa  318  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  65.53 
 
 
247 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  65.53 
 
 
247 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  65.53 
 
 
247 aa  317  8e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  65.81 
 
 
247 aa  315  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0565  uridylate kinase  63.98 
 
 
253 aa  315  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2595  uridylate kinase  61.67 
 
 
247 aa  313  1e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0151239  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  63.83 
 
 
249 aa  313  2e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  65.38 
 
 
247 aa  313  2e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  64.68 
 
 
245 aa  311  4e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17080  uridylate kinase  64.68 
 
 
245 aa  311  7e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1543  uridylate kinase  60.67 
 
 
243 aa  310  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  65.09 
 
 
246 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  65.09 
 
 
247 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0610  uridylate kinase  60.67 
 
 
243 aa  310  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.139301  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  59.41 
 
 
247 aa  303  2e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  59.41 
 
 
247 aa  302  4e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  55.42 
 
 
245 aa  285  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0810  uridylate kinase  58.3 
 
 
243 aa  282  4e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  55.83 
 
 
242 aa  282  4e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  56.22 
 
 
240 aa  281  7e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  54.89 
 
 
242 aa  280  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0529  uridylate kinase  60.26 
 
 
249 aa  279  2e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.578978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  53.97 
 
 
240 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  54.89 
 
 
243 aa  274  7e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  53.33 
 
 
246 aa  274  9e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  55.32 
 
 
242 aa  273  1e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  54.27 
 
 
241 aa  273  2e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  54.27 
 
 
241 aa  273  2e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  54.24 
 
 
243 aa  271  5e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  55.79 
 
 
246 aa  271  8e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  53.97 
 
 
238 aa  270  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  54.74 
 
 
237 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  54.74 
 
 
237 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  54.74 
 
 
237 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  54.74 
 
 
237 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  54.74 
 
 
237 aa  269  3e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  55.36 
 
 
236 aa  269  3e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  54.94 
 
 
236 aa  269  3e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  54.08 
 
 
236 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  54.08 
 
 
236 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  54.08 
 
 
236 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  54.08 
 
 
258 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  54.24 
 
 
286 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  54.31 
 
 
237 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  54.31 
 
 
237 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  54.31 
 
 
237 aa  266  3e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  54.31 
 
 
237 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  54.31 
 
 
237 aa  266  3e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  51.88 
 
 
240 aa  266  3e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  54.31 
 
 
237 aa  266  3e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  54.31 
 
 
237 aa  266  3e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>