More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3525 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  63.05 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  41.64 
 
 		 662 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  44.04 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  39.69 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  39.69 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  38.94 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  38.63 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  41.01 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  38.96 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  39.13 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  39.33 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  39.51 
 
 		 346 aa  215  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  39.8 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  39.8 
 
 		 321 aa  215  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  38.8 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  39.46 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  38.8 
 
 		 321 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  37.74 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000324878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  37.11 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  37.42 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1737099999999999e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  37.42 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000270129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  37.42 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  37.78 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  37.74 
 
 		 320 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  39.58 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  37.11 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000010516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  36.05 
 
 		 321 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  38.48 
 
 		 336 aa  198  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  39.29 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  36.08 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  37.96 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  39.86 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  36.3 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  31.61 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  36.2 
 
 		 353 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  36.2 
 
 		 353 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  36.2 
 
 		 353 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.3 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  35.33 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000014163  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  35.33 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  30.99 
 
 		 348 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  31.41 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  33.33 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  35 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  32.19 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  32.41 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  30.96 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  32.55 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  31.38 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4278  periplasmic binding protein  35.25 
 
 		 405 aa  132  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170406  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0694  putative iron compound-binding protein  28.25 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00869259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4317  substrate-binding family protein  27.6 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000712566  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4166  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.6 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000245758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4652  substrate-binding family protein  27.6 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0152488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4501  putative iron compound-binding protein  27.6 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4541  putative iron compound-binding protein  27.78 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00289345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4155  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.27 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000676883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3139  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000355327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5509  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.97 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5229  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.97 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5060  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.97 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.320975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5077  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.97 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5628  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  27.97 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5472  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.3 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5173  periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5448  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.47 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5503  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.47 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5558  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.06 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3901  periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0794  periplasmic binding protein  31.14 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.352793  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  28.36 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2207  periplasmic binding protein  30.62 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185763 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0807  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  29.93 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.426992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1806  periplasmic binding protein  28.67 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455628  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5939  periplasmic binding protein  32.34 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587353  normal  0.774281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  29.13 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.68 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  29.81 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1763  periplasmic binding protein  31.85 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.361737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  29.91 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2035  periplasmic binding protein  31.05 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1928  periplasmic binding protein  29.11 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.0105947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5028  periplasmic binding protein  33.67 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  28.3 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.09 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  29.09 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  29.09 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1462  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.47 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000294179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3837  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.47 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  25.57 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3787  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.78 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3483  iron(III) dicitrate-binding protein  27.78 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.243562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3495  iron(III) dicitrate-binding protein  27.78 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889326  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  25.81 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3771  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.78 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3749  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.78 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000167124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>