159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2396 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  100 
 
 
280 aa  563  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  50 
 
 
257 aa  268  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  51.92 
 
 
257 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  53.71 
 
 
252 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  53.71 
 
 
252 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  53.28 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  51.52 
 
 
254 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  52.4 
 
 
256 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  51.53 
 
 
256 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  45.91 
 
 
276 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  45.91 
 
 
286 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  52.4 
 
 
249 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  46.72 
 
 
257 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  41.56 
 
 
248 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  53.48 
 
 
333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.53 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.17 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  40.53 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.17 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.17 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  41.13 
 
 
248 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.77 
 
 
268 aa  196  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.78 
 
 
255 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.3 
 
 
248 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  38.89 
 
 
268 aa  181  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.17 
 
 
251 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.74 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.74 
 
 
268 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.74 
 
 
268 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.3 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.1 
 
 
253 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  35.84 
 
 
272 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0518  thiol:disulfide interchange protein DsbG  41.53 
 
 
141 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.63 
 
 
255 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  34.63 
 
 
283 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  30.53 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  38.94 
 
 
122 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  34.31 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  30.06 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  29.93 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  29.93 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  30.77 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.77 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  32.46 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  32.46 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  29.01 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  29.01 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  33.09 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  34.29 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  37.19 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1075  hypothetical protein  24.45 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00702033  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  37.78 
 
 
399 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.67 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  30 
 
 
248 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  30.43 
 
 
248 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  33.9 
 
 
182 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1066  thiol:disulfide interchange protein  25.26 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1150  hypothetical protein  28.46 
 
 
267 aa  58.9  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000405305  normal  0.155093 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  31.9 
 
 
533 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  25.77 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  32.52 
 
 
530 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.24 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2546  protein-disulfide isomerase-like protein  26.06 
 
 
235 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  26.95 
 
 
235 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  24.27 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4190  hypothetical protein  29.29 
 
 
430 aa  55.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.38 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0862  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.65 
 
 
238 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1475  thiol:disulfide interchange protein  22.94 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.653539  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  23.53 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  25.82 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  24.85 
 
 
252 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.98 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0563  thiol/disulfide interchange protein DsbC precursor  25.28 
 
 
258 aa  53.9  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0850  hypothetical protein  26.04 
 
 
268 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.842936  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.59 
 
 
254 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.91 
 
 
237 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.91 
 
 
237 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.91 
 
 
237 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.91 
 
 
237 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2009  protein-disulfide isomerase-like protein  25.46 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0221449  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.91 
 
 
237 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  25.75 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.04 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2126  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.15 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.43 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  22.61 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  24.12 
 
 
255 aa  48.9  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  25.73 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.37 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0652  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.75 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.317088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  23.9 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.29 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.73 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  27.33 
 
 
242 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.29 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.29 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  25.73 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1469  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.57 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838992  normal  0.213386 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>