38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3831 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  98.83 
 
 		 342 aa  693    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  97.95 
 
 		 342 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  73.62 
 
 		 345 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  73.62 
 
 		 345 aa  510  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  72.75 
 
 		 345 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  71.88 
 
 		 345 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  52.3 
 
 		 340 aa  371  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  52.03 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  49.42 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  52.33 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  48.27 
 
 		 338 aa  334  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  33.03 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000125522  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  30.65 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  31.44 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  30.54 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  31.14 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  31.14 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  30.24 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  30.24 
 
 		 337 aa  149  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  30.84 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  26.65 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  29.03 
 
 		 360 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  28.74 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  28.65 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  29.84 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  25.61 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  25.59 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  25.61 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  23.05 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  31.73 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  23.68 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  28.57 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  23.27 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  24.82 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  26.8 
 
 		 523 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  24.07 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  21.36 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>