78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2219 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  69.18 
 
 		 594 aa  899    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  65.66 
 
 		 596 aa  845    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  99.66 
 
 		 596 aa  1240    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  100 
 
 		 596 aa  1245    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  84.56 
 
 		 592 aa  1082    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  65.38 
 
 		 595 aa  840    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  86.41 
 
 		 595 aa  1107    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  99.16 
 
 		 596 aa  1236    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  67.88 
 
 		 604 aa  887    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  64.99 
 
 		 594 aa  853    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  86.07 
 
 		 595 aa  1104    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  65.05 
 
 		 595 aa  845    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  61.91 
 
 		 594 aa  775    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  93.62 
 
 		 596 aa  1176    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  86.58 
 
 		 595 aa  1108    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  86.24 
 
 		 595 aa  1107    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  35.1 
 
 		 602 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  34.27 
 
 		 602 aa  365  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  34.29 
 
 		 600 aa  362  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  33.33 
 
 		 601 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  31.24 
 
 		 586 aa  296  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  31.24 
 
 		 586 aa  296  9e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  31.07 
 
 		 586 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  31.07 
 
 		 586 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  31.07 
 
 		 586 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  31.07 
 
 		 586 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  31.07 
 
 		 586 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  31.07 
 
 		 586 aa  294  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  31.07 
 
 		 586 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  31.86 
 
 		 593 aa  294  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  31.35 
 
 		 586 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  30.91 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  30.91 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  30.91 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  31.19 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  31.2 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  31.19 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  31.19 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  30.97 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  30.43 
 
 		 580 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  30.31 
 
 		 586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  30.79 
 
 		 590 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  29.37 
 
 		 582 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  29.59 
 
 		 582 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  29.64 
 
 		 590 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  30.24 
 
 		 613 aa  225  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  30.16 
 
 		 615 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  28.06 
 
 		 617 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  28.06 
 
 		 617 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  28.35 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  28.11 
 
 		 609 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  25.16 
 
 		 622 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  24.92 
 
 		 637 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  23.42 
 
 		 647 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  23.8 
 
 		 638 aa  184  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  24.75 
 
 		 637 aa  183  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  24.79 
 
 		 600 aa  180  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  26.07 
 
 		 607 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2610  hypothetical protein  27.11 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  26.72 
 
 		 607 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  25 
 
 		 635 aa  170  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  25 
 
 		 638 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  26.9 
 
 		 625 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3380  alkaline phosphatase superfamily hydrolase  31.58 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.99522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  26.29 
 
 		 624 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01909  Membrane-associated hydrolase of alkaline phosphatase superfamily protein  29.43 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.558956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  27.93 
 
 		 614 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  24.4 
 
 		 642 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  23.95 
 
 		 641 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  23.77 
 
 		 621 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  24.23 
 
 		 621 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  23.26 
 
 		 621 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  20.95 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  25.38 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  24.32 
 
 		 597 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2806  hypothetical protein  39.13 
 
 		 665 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  22.33 
 
 		 873 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  27.19 
 
 		 450 aa  44.3  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>