26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0631 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3398  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0631  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000012648  normal  0.149121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0631  hypothetical protein  95.28 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000129796  normal  0.0702813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4011  hypothetical protein  92.7 
 
 		 233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0660  hypothetical protein  88.41 
 
 		 233 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3681  hypothetical protein  86.7 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3864  hypothetical protein  86.7 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0587  hypothetical protein  86.7 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3738  hypothetical protein  86.7 
 
 		 233 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3786  hypothetical protein  71.24 
 
 		 233 aa  360  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000100132  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0714  hypothetical protein  72.53 
 
 		 234 aa  358  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000507099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3887  hypothetical protein  70.39 
 
 		 233 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0229924  normal  0.0459131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3197  hypothetical protein  70.43 
 
 		 232 aa  344  7e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3163  hypothetical protein  69.53 
 
 		 252 aa  341  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3119  hypothetical protein  67.81 
 
 		 237 aa  329  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000244362  unclonable  0.0000043186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0591  hypothetical protein  64.78 
 
 		 233 aa  320  9.000000000000001e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000830224  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2539  hypothetical protein  54.08 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4402  hypothetical protein  45.06 
 
 		 235 aa  221  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2117  hypothetical protein  49.77 
 
 		 236 aa  220  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003724  hypothetical protein  45.92 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000435899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1490  hypothetical protein  44.44 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0905179  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0821  hypothetical protein  46.78 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000458892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02065  hypothetical protein  45.65 
 
 		 241 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0840  hypothetical protein  45.15 
 
 		 251 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.220158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1335  hypothetical protein  49.77 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1766  hypothetical protein  44.64 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>