32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0568 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  100 
 
 		 255 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  99.22 
 
 		 255 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  99.22 
 
 		 259 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  95.28 
 
 		 259 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  88.8 
 
 		 262 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  91.27 
 
 		 266 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  90.87 
 
 		 266 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  90.87 
 
 		 266 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  90.87 
 
 		 266 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  80.49 
 
 		 261 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  75 
 
 		 265 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  79.2 
 
 		 251 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  79.27 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  79.67 
 
 		 263 aa  362  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  73.98 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  75.79 
 
 		 263 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  42.11 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  41.15 
 
 		 264 aa  176  5e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  49.78 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  34.32 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  34.03 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  35.5 
 
 		 466 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  32.82 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  28.28 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  28.92 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  30.47 
 
 		 274 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  29.69 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  27.74 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  27.74 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  38.36 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 		 267 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>