38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0092 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  92.28 
 
 
337 aa  645  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  692  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  92.58 
 
 
337 aa  646  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  92.88 
 
 
337 aa  649  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  99.11 
 
 
337 aa  686  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  99.7 
 
 
337 aa  691  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  92.58 
 
 
337 aa  647  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  39.76 
 
 
337 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.25522e-07  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  39.05 
 
 
338 aa  234  2e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  37.46 
 
 
332 aa  219  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  29.22 
 
 
345 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  30.03 
 
 
338 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  29.75 
 
 
340 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  27.54 
 
 
345 aa  136  6e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  29.54 
 
 
336 aa  135  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  28.74 
 
 
345 aa  135  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  28.14 
 
 
336 aa  133  4e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  27.54 
 
 
345 aa  132  1e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  28.06 
 
 
342 aa  129  7e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  27.84 
 
 
342 aa  129  9e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  27.84 
 
 
342 aa  127  2e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  31.28 
 
 
336 aa  114  2e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  29.25 
 
 
323 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  31.72 
 
 
364 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  31.72 
 
 
360 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  32.89 
 
 
360 aa  92.8  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  31.28 
 
 
364 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  25.38 
 
 
329 aa  84  3e-15  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  32.05 
 
 
318 aa  79.7  6e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  24.92 
 
 
367 aa  73.6  4e-12  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  30.19 
 
 
373 aa  73.6  5e-12  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  24.82 
 
 
296 aa  73.2  7e-12  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  27.32 
 
 
523 aa  64.7  2e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  27.73 
 
 
315 aa  62.8  8e-09  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  22.03 
 
 
321 aa  59.7  7e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  23.63 
 
 
346 aa  57.4  4e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  21.43 
 
 
330 aa  52  1e-05  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  26.09 
 
 
324 aa  52.4  1e-05  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>