48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0012 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  302  1e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03173e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  99.31 
 
 
145 aa  301  3e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  97.24 
 
 
145 aa  290  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  1.72861e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  87.59 
 
 
145 aa  265  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  82.64 
 
 
148 aa  249  8e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  82.64 
 
 
148 aa  249  8e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  82.64 
 
 
148 aa  249  9e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  81.94 
 
 
148 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49396e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  79.17 
 
 
150 aa  237  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  68.75 
 
 
146 aa  210  6e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  68.53 
 
 
147 aa  202  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  65.97 
 
 
146 aa  201  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  66.9 
 
 
149 aa  199  1e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.70125e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  64.58 
 
 
155 aa  197  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  64.58 
 
 
145 aa  196  1e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  41.72 
 
 
151 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  40.52 
 
 
156 aa  89.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  35.54 
 
 
206 aa  62  2e-09  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  35.53 
 
 
178 aa  61.2  5e-09  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  28.87 
 
 
167 aa  60.5  7e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  28.47 
 
 
181 aa  60.5  7e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  35.66 
 
 
151 aa  55.5  2e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  30.28 
 
 
184 aa  53.5  9e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  30.87 
 
 
165 aa  52.4  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  29.86 
 
 
182 aa  52.4  2e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  26.03 
 
 
175 aa  50.8  5e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  35.83 
 
 
144 aa  50.8  6e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  36.21 
 
 
155 aa  49.7  1e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  26.95 
 
 
146 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  23.94 
 
 
147 aa  48.9  2e-05  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  30.77 
 
 
151 aa  48.5  3e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  25 
 
 
174 aa  47.8  6e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  24.32 
 
 
177 aa  47.4  7e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  26.39 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1481  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  26.23 
 
 
310 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  23.61 
 
 
142 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  23.61 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  25.53 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  33.65 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  24.16 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  26.47 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  25 
 
 
211 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0491  MOSC domain containing protein  27.86 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0514141  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  31.13 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2061  hypothetical protein  27.59 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  2.6195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  26.17 
 
 
142 aa  40.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2403  MOSC domain-containing protein  26.5 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0524087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  25.81 
 
 
549 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>