More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2264 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  59.44 
 
 
579 aa  668  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  97.95 
 
 
585 aa  1158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  98.29 
 
 
585 aa  1160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  78.56 
 
 
600 aa  909  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  76.95 
 
 
576 aa  902  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  94.02 
 
 
585 aa  1106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  1.94119e-07 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  59.44 
 
 
579 aa  668  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  94.7 
 
 
590 aa  1111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  94.02 
 
 
585 aa  1106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  69.58 
 
 
592 aa  815  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  98.63 
 
 
585 aa  1168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  58.54 
 
 
567 aa  647  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  79.41 
 
 
578 aa  915  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  94.02 
 
 
585 aa  1106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  100 
 
 
585 aa  1182  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  75.04 
 
 
592 aa  845  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  94.02 
 
 
585 aa  1106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  67.67 
 
 
591 aa  788  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  43.9 
 
 
578 aa  417  1e-115  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  45.01 
 
 
568 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  45.01 
 
 
568 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  44.82 
 
 
568 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  43.71 
 
 
573 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  44.4 
 
 
569 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  37.76 
 
 
560 aa  353  6e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  34.46 
 
 
565 aa  329  7e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  34.1 
 
 
574 aa  321  3e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  35.43 
 
 
575 aa  315  1e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  37.38 
 
 
575 aa  299  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  35.65 
 
 
573 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  34.48 
 
 
595 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  35.12 
 
 
570 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  34.5 
 
 
579 aa  291  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  34.62 
 
 
580 aa  290  5e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  34.24 
 
 
570 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  35.07 
 
 
570 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  34.57 
 
 
590 aa  283  5e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  34.36 
 
 
596 aa  280  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  34.78 
 
 
590 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  34.49 
 
 
583 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  36.65 
 
 
566 aa  275  1e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  35.01 
 
 
592 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  33.89 
 
 
605 aa  272  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  34.37 
 
 
559 aa  269  9e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  34.68 
 
 
574 aa  267  3e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  32.46 
 
 
586 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  34.44 
 
 
587 aa  263  5e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  31.82 
 
 
576 aa  263  5e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  33.9 
 
 
582 aa  263  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  33.21 
 
 
569 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  30.43 
 
 
569 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  30.43 
 
 
569 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  33.79 
 
 
572 aa  257  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  32.9 
 
 
571 aa  253  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  34.57 
 
 
556 aa  252  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.67 
 
 
610 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.67 
 
 
610 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.67 
 
 
610 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.67 
 
 
610 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  32.67 
 
 
610 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  32.67 
 
 
610 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  32.67 
 
 
610 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  30.24 
 
 
588 aa  243  9e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  32.33 
 
 
576 aa  238  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  30.63 
 
 
584 aa  233  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  30.93 
 
 
567 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  31.53 
 
 
588 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  33.4 
 
 
585 aa  227  5e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  30.96 
 
 
563 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  30.34 
 
 
591 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  32.44 
 
 
557 aa  222  1e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  31.44 
 
 
574 aa  222  1e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  31.98 
 
 
558 aa  218  3e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  33.78 
 
 
581 aa  218  3e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  31.1 
 
 
605 aa  218  3e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  33.85 
 
 
573 aa  218  3e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  30.16 
 
 
585 aa  216  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  29.3 
 
 
575 aa  213  6e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  30.52 
 
 
570 aa  209  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  30.99 
 
 
574 aa  207  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  32.29 
 
 
550 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  28.6 
 
 
578 aa  203  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  30.93 
 
 
550 aa  202  1e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  29.17 
 
 
585 aa  202  1e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  29.04 
 
 
583 aa  202  2e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  32.5 
 
 
558 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  30.69 
 
 
565 aa  201  4e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  29.45 
 
 
570 aa  199  1e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  28.14 
 
 
572 aa  199  1e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  27.91 
 
 
588 aa  198  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  27.42 
 
 
565 aa  197  4e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  26.86 
 
 
571 aa  197  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  26.87 
 
 
566 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  28.47 
 
 
590 aa  196  8e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  30.7 
 
 
586 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  31.78 
 
 
577 aa  193  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  31.46 
 
 
576 aa  193  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  26.12 
 
 
626 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  29.75 
 
 
583 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5729  sulphate transporter  30.32 
 
 
572 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.46333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>