258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1628 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1628  acylphosphatase  100 
 
 		 89 aa  180  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000020913  normal  0.189828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2835  acylphosphatase  65.91 
 
 		 91 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000760642  hitchhiker  0.000425949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1809  acylphosphatase  63.64 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000689172  normal  0.0364693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1328  acylphosphatase  56.82 
 
 		 91 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1950  acylphosphatase  53.41 
 
 		 97 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103444  normal  0.209392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2513  acylphosphatase  53.41 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000309341  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2397  acylphosphatase  53.41 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221356  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2408  acylphosphatase  53.41 
 
 		 91 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000467903  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2160  acylphosphatase  52.27 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2253  acylphosphatase  53.41 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1728  acylphosphatase  53.41 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352005  normal  0.358001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2291  acylphosphatase  53.41 
 
 		 90 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0355652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1808  acylphosphatase  53.41 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1541  acylphosphatase  61.36 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0703  acylphosphatase  44.83 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1183  acylphosphatase  43.02 
 
 		 92 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.858645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0713  acylphosphatase  40.91 
 
 		 92 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.527846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2243  acylphosphatase  52.17 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1158  acylphosphatase  40.7 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216126  normal  0.513068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1124  acylphosphatase  40.7 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.8259399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1192  acylphosphatase  40.7 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1146  acylphosphatase  40.7 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137289  normal  0.225824 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0509  acylphosphatase  41.38 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1041  acylphosphatase  40.7 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.860635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4069  acylphosphatase  47.95 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1427  acylphosphatase  39.08 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223488  normal  0.163349 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2406  acylphosphatase  43.42 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31927  normal  0.925907 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1839  acylphosphatase  49.3 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.831487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0240  acylphosphatase  38.64 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1480  acylphosphatase  42.68 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0319671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1219  acylphosphatase  41.38 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4481  acylphosphatase  41.03 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2346  acylphosphatase  40.7 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.204273  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1227  acylphosphatase  40.91 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1228  acylphosphatase  40.91 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00087614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0889  acylphosphatase  38.37 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2149  acylphosphatase  39.08 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.054782  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3210  acylphosphatase  37.65 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00151409  hitchhiker  0.00225794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2619  acylphosphatase  37.65 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2530  acylphosphatase  37.65 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.306115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0522  acylphosphatase  47.76 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606766 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1977  acylphosphatase  43.68 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.560432  normal  0.812753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0770  acylphosphatase  40.26 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1796  acylphosphatase  38.37 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.333863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0824  acylphosphatase  42.11 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0730  acylphosphatase  42.47 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2848  acylphosphatase  47.89 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0241308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0520  acylphosphatase  41.1 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.230918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0794  acylphosphatase  42.42 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.364443  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00972  predicted acylphosphatase  39.53 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0682612  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2675  acylphosphatase  39.53 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000389922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1765  acylphosphatase  45.12 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00140715  hitchhiker  0.00160768 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7041  acylphosphatase  36.9 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.925608  hitchhiker  0.000175796 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2628  acylphosphatase  39.53 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0934833  hitchhiker  0.0000175619 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00979  hypothetical protein  39.53 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1134  acylphosphatase  39.53 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0023  acylphosphatase  36.9 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4125  acylphosphatase  37.8 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6207  acylphosphatase  40.58 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0920  acylphosphatase  39.08 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2539  acylphosphatase  47.83 
 
 		 92 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0210008  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1692  acylphosphatase  35.96 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.205499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2257  acylphosphatase  40.51 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1052  acylphosphatase  40.7 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.424464  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1869  acylphosphatase  37.08 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0311  acylphosphatase  36.36 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422172  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0729  acylphosphatase  39.73 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2679  acylphosphatase  37.93 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0859  putative acylphosphatase  38.75 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2729  acylphosphatase  37.84 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0694  acylphosphatase  39.73 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.509759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2688  acylphosphatase  46.38 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0086  acylphosphatase  39.08 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.186616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0560  acylphosphatase  44.62 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.373142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3843  acylphosphatase  35.56 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0091  acylphosphatase  43.9 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.104703  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2095  acylphosphatase  43.9 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.451224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2174  acylphosphatase  37.65 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1686  acylphosphatase  40.51 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333589  normal  0.382627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36780  acylphosphatase  41.03 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0888  acylphosphatase  44.16 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000010114  n/a   
 
 
 
NC_010085  Nmar_0103  acylphosphatase  33.33 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00111331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1304  acylphosphatase  37.21 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000789837  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1932  acylphosphatase  38.1 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0487108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1952  acylphosphatase  38.1 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1396  acylphosphatase  39.08 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1998  acylphosphatase  38.1 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.635569  normal  0.522288 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2447  acylphosphatase  39.47 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1706  acylphosphatase  38.64 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.531567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1158  acylphosphatase  37.21 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0933267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0681  acylphosphatase  37.78 
 
 		 91 aa  57  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.790146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4771  acylphosphatase  42.25 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000297446  normal  0.0367606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3258  acylphosphatase  38.57 
 
 		 98 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2248  acylphosphatase  39.29 
 
 		 89 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.946619  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4198  acylphosphatase  34.48 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.0019532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0653  acylphosphatase  42.67 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12937  acylphosphatase  36.47 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00163956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1419  acylphosphatase  40 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1169  acylphosphatase  38.27 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1245  acylphosphatase  40 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>