More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1392 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1392  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 143 aa  299  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1429  ferric uptake regulator family protein  99.3 
 
 		 143 aa  298  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0586  ferric uptake regulator, Fur family protein  77.62 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  42.96 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  41.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  41.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  41.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  41.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  41.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  41.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  41.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  41.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  41.67 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4555  ferric uptake regulator family protein  42.45 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1593  ferric uptake regulator  43.31 
 
 		 143 aa  124  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000083166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2338  ferric uptake regulator  44.09 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.807618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  43.38 
 
 		 150 aa  123  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  43.38 
 
 		 150 aa  123  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  43.38 
 
 		 150 aa  123  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  43.38 
 
 		 150 aa  123  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  43.38 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2152  ferric uptake regulator  44.53 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  44.12 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1123  ferric uptake regulator family protein  46.46 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.488583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004126  ferric uptake regulation protein FUR  42.75 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  41.84 
 
 		 147 aa  121  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  44.88 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  44.62 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  44.62 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  43.08 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  42.96 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  42.42 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  42.03 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  43.31 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  44.44 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  44.44 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  47.15 
 
 		 136 aa  120  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  45.52 
 
 		 142 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  42.52 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  44.09 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  42.52 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  42.52 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  41.98 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  42.22 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  41.73 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1575  ferric uptake regulator  44.53 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  43.31 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  42.34 
 
 		 145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  42.52 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  42.52 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  42.52 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  42.52 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3272  ferric uptake regulator, Fur family  40.91 
 
 		 138 aa  117  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.710175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0474  ferric uptake regulator family protein  42.86 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0753  ferric uptake regulator family protein  43.65 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.629039  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3924  ferric uptake regulator family protein  40.91 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3791  ferric uptake regulator family protein  43.97 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  43.31 
 
 		 143 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  43.31 
 
 		 143 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  39.26 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0458  ferric uptake regulator, Fur family  44.88 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000485327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  40.91 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0282  ferric uptake regulation protein  44.88 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  41.48 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  45.04 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2986  ferric uptake regulator, Fur family  42.97 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.105319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2576  ferric uptake regulator, Fur family  42.97 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.710249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  41.73 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  41.48 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  41.61 
 
 		 143 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  45.31 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  40.14 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2747  ferric uptake transcriptional repressor transcription regulator protein  42.97 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  40.14 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0570  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  40.91 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  40.14 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0603  ferric uptake regulator family protein  39.39 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.401566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  39.72 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3735  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345676 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1206  ferric uptake regulator  44.44 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2976  ferric uptake regulator family protein  41.18 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0166  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2737  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.348547  normal  0.830954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0616  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.740565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0649  ferric uptake regulator family protein  44.44 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1234  ferric uptake regulator  44.44 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  44.44 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2837  ferric uptake regulator family protein  41.18 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3457  ferric uptake regulator  44.44 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  44.44 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3420  ferric uptake regulator  44.44 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3455  ferric uptake regulator  44.44 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  44.44 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0934  ferric uptake regulator family protein  41.27 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.634788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  42.75 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  43.75 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  40.46 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3365  ferric uptake regulator family protein  42.4 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.019724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>