40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0012 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  306  7e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  97.97 
 
 
148 aa  302  8e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  97.97 
 
 
148 aa  301  2e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49396e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  97.3 
 
 
148 aa  301  3e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  83.78 
 
 
150 aa  254  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  82.64 
 
 
145 aa  249  9e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03173e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  81.94 
 
 
145 aa  248  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  81.94 
 
 
145 aa  246  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  1.72861e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  82.52 
 
 
145 aa  241  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  67.12 
 
 
146 aa  206  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  63.01 
 
 
146 aa  197  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  65.28 
 
 
155 aa  195  1e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  66.2 
 
 
147 aa  194  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  66.2 
 
 
149 aa  194  4e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.70125e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  62.07 
 
 
145 aa  185  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  42 
 
 
151 aa  103  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  40.13 
 
 
156 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  33.07 
 
 
206 aa  57  8e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  25.83 
 
 
181 aa  55.8  2e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  27.46 
 
 
167 aa  55.5  3e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  31.03 
 
 
184 aa  54.3  6e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0430  MOSC domain-containing protein  30.67 
 
 
151 aa  52.4  2e-06  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.458415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  33.11 
 
 
178 aa  50.1  1e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  28.87 
 
 
165 aa  47.8  5e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  31.25 
 
 
151 aa  47.4  7e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  26.21 
 
 
175 aa  47  9e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  28.69 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  27.27 
 
 
182 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  25.6 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  26.35 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  26.35 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  27.08 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2061  hypothetical protein  24.79 
 
 
148 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  2.6195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  23.02 
 
 
211 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  31.9 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  25.69 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1759  MOSC domain-containing protein  23.45 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  26.9 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2044  MOSC domain-containing protein  23.45 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>