More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22020 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22020  N-acetylglutamate kinase  100 
 
 
330 aa  665  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.869961  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2342  acetylglutamate kinase  52.7 
 
 
328 aa  315  8e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  47.83 
 
 
309 aa  282  5e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  47.83 
 
 
309 aa  282  5e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  52.36 
 
 
297 aa  281  8e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  50.18 
 
 
297 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 
296 aa  274  2e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  47.89 
 
 
299 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1153  acetylglutamate kinase  45.55 
 
 
292 aa  268  7e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0296435  hitchhiker  0.00582367 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  48.94 
 
 
299 aa  266  3e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3059  acetylglutamate kinase  47.16 
 
 
333 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0761977  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1674  acetylglutamate kinase  48.54 
 
 
301 aa  262  5e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5469  acetylglutamate kinase  48.23 
 
 
304 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  48.08 
 
 
298 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3173  acetylglutamate kinase  47.16 
 
 
362 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0759623  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2371  acetylglutamate kinase  44.44 
 
 
312 aa  259  5e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0310065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02840  acetylglutamate kinase  46.45 
 
 
290 aa  259  6e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00137776  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  47.29 
 
 
287 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 
304 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2153  acetylglutamate kinase  46.81 
 
 
298 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.38654e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  47.62 
 
 
300 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  47.45 
 
 
334 aa  255  7e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  45.85 
 
 
300 aa  255  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1329  acetylglutamate kinase  45.96 
 
 
355 aa  254  1e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.114044  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05631  acetylglutamate kinase  47.45 
 
 
283 aa  254  1e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1950  acetylglutamate kinase  48.06 
 
 
300 aa  254  1e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  46.38 
 
 
283 aa  254  2e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  44.98 
 
 
301 aa  252  5e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  46.34 
 
 
295 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1152  acetylglutamate kinase  48.55 
 
 
289 aa  252  8e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.749063  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0500  acetylglutamate kinase  46.62 
 
 
283 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1261  acetylglutamate kinase  47.37 
 
 
296 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.101538 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  45.52 
 
 
301 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05261  acetylglutamate kinase  45.55 
 
 
283 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3613  acetylglutamate kinase  46.43 
 
 
288 aa  250  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.522961  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  44.83 
 
 
300 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05561  acetylglutamate kinase  45.91 
 
 
283 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.91798  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0684  acetylglutamate kinase  48.72 
 
 
293 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  45.23 
 
 
296 aa  249  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2055  acetylglutamate kinase  49.65 
 
 
302 aa  248  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.340401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  46.29 
 
 
283 aa  248  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1883  acetylglutamate kinase  45.3 
 
 
295 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0336877  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0224  acetylglutamate kinase  45.13 
 
 
279 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1113  acetylglutamate kinase  43.71 
 
 
320 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.736746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  46.37 
 
 
295 aa  247  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1041  acetylglutamate kinase  45.71 
 
 
282 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0274311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  45.14 
 
 
301 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5454  acetylglutamate kinase  44.11 
 
 
300 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0243823  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  45.14 
 
 
301 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  45.14 
 
 
301 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  1.57401e-07 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  44.22 
 
 
294 aa  246  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  2.92258e-06 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  45.14 
 
 
301 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  45.73 
 
 
295 aa  246  5e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0251  acetylglutamate kinase  44.77 
 
 
279 aa  245  7e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  44.14 
 
 
301 aa  245  7e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  47.46 
 
 
284 aa  245  8e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1739  acetylglutamate kinase  47.69 
 
 
344 aa  245  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  44.14 
 
 
301 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  44.52 
 
 
301 aa  244  1e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1071  acetylglutamate kinase  45.36 
 
 
282 aa  244  1e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0437011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  45.52 
 
 
287 aa  244  1e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0277  acetylglutamate kinase  44.4 
 
 
279 aa  243  2e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  45.64 
 
 
305 aa  244  2e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3064  acetylglutamate kinase  45.58 
 
 
297 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0126783  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  45.26 
 
 
291 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  46.74 
 
 
285 aa  242  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0127  acetylglutamate kinase  44.79 
 
 
294 aa  241  9e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.303702  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3159  acetylglutamate kinase  45.15 
 
 
300 aa  241  9e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.553724  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  44.98 
 
 
302 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  1.96007e-12 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  43.15 
 
 
290 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  43.75 
 
 
301 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  43.75 
 
 
301 aa  239  6e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1890  acetylglutamate kinase  45.58 
 
 
310 aa  239  6e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.259504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  43.75 
 
 
301 aa  239  6e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2911  acetylglutamate kinase  46.13 
 
 
303 aa  238  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  43.37 
 
 
288 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0327  acetylglutamate kinase  45.21 
 
 
287 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  42.24 
 
 
300 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  43.9 
 
 
300 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1498  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 
310 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07341  acetylglutamate kinase  46.89 
 
 
308 aa  236  5e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0814  acetylglutamate kinase  45.61 
 
 
314 aa  236  5e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2470  acetylglutamate kinase  46.67 
 
 
312 aa  235  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  44.44 
 
 
292 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2029  acetylglutamate kinase  47.24 
 
 
305 aa  235  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6075  Acetylglutamate kinase  44.95 
 
 
322 aa  234  1e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733512  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4129  acetylglutamate kinase  44.01 
 
 
309 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0223345  hitchhiker  7.027e-06 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  43.17 
 
 
290 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  1.09203e-08 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  44.44 
 
 
293 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  44.44 
 
 
293 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  43.17 
 
 
290 aa  233  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1078  acetylglutamate kinase  42.81 
 
 
294 aa  233  4e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3230  acetylglutamate kinase  42.31 
 
 
294 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  42.96 
 
 
300 aa  232  7e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  45.3 
 
 
292 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  42.86 
 
 
306 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  43.21 
 
 
281 aa  230  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1499  acetylglutamate kinase  45.61 
 
 
319 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29185e-07 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1832  acetylglutamate kinase  46.52 
 
 
304 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.913533  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05571  acetylglutamate kinase  46.52 
 
 
304 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0678457  normal  0.267137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>