18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2371 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  100 
 
 
1267 aa  2524    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  30.22 
 
 
884 aa  129  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  22.41 
 
 
1017 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  28.98 
 
 
1134 aa  115  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  31.28 
 
 
882 aa  115  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  26.82 
 
 
1125 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  29.35 
 
 
882 aa  109  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  26.91 
 
 
1347 aa  102  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  26.21 
 
 
865 aa  97.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  25.74 
 
 
1110 aa  94.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  21.81 
 
 
1279 aa  91.7  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  26.96 
 
 
1152 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  23.04 
 
 
1296 aa  75.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  22.04 
 
 
1278 aa  68.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5106  hypothetical protein  30.77 
 
 
857 aa  68.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141867  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5046  hypothetical protein  30.89 
 
 
325 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  23.87 
 
 
1343 aa  52  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  23.86 
 
 
1123 aa  51.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>