More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1226 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  339  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  39.86 
 
 
161 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  40.52 
 
 
171 aa  120  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  40.52 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  40.52 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  42.68 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  41.55 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  38.56 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  42.86 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  37.24 
 
 
165 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  37.84 
 
 
152 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  40.54 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  41.89 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  40.54 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  36.11 
 
 
156 aa  112  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  40.56 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  40.88 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  39.86 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  38.04 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  35.9 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  36.3 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  39.61 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  37.84 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  42.75 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  37.01 
 
 
159 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  37.32 
 
 
154 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  37.32 
 
 
151 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  40.16 
 
 
151 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  38.73 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  37.32 
 
 
151 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  37.42 
 
 
159 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  38.51 
 
 
169 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  34.03 
 
 
153 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  36.62 
 
 
151 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  36.36 
 
 
151 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  40.88 
 
 
153 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  36.81 
 
 
154 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  39.19 
 
 
158 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  37.76 
 
 
152 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  37.76 
 
 
152 aa  104  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  35.86 
 
 
154 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  34.9 
 
 
157 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  38.62 
 
 
150 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  36.23 
 
 
155 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  36.08 
 
 
166 aa  102  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  36.23 
 
 
151 aa  101  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  38.74 
 
 
154 aa  101  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  39.29 
 
 
153 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  36.62 
 
 
151 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  34.67 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  36.11 
 
 
153 aa  99  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  35.57 
 
 
154 aa  99  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  39.57 
 
 
153 aa  99  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  36.5 
 
 
151 aa  99  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  36.5 
 
 
151 aa  99  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  38.46 
 
 
152 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  37.23 
 
 
152 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  37.23 
 
 
152 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  34.48 
 
 
154 aa  98.6  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1866  hypothetical protein  35 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.182542  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  34.9 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  34.06 
 
 
151 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  36.5 
 
 
151 aa  97.8  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  34.03 
 
 
153 aa  97.8  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  34.06 
 
 
151 aa  97.4  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  97.4  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  34.75 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  36.31 
 
 
185 aa  96.7  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  35.51 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  37.23 
 
 
145 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  33.11 
 
 
157 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  36.31 
 
 
160 aa  94.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  36.94 
 
 
160 aa  94  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  35.46 
 
 
151 aa  94  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0065  hypothetical protein  37.96 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000828588  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  32.21 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  32.21 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  38.69 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  38.69 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  35.96 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  35.96 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  38.69 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  35.96 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  35.96 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  35.96 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  32.21 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  38.69 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  35.96 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  38.69 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  38.69 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  38.69 
 
 
150 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  35.61 
 
 
151 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  36.21 
 
 
156 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>