More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0007 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
487 aa  1005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0122  amidophosphoribosyltransferase  60.78 
 
 
467 aa  565  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  58.53 
 
 
461 aa  561  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  59.14 
 
 
463 aa  553  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  59.02 
 
 
462 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
477 aa  542  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
477 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  58.68 
 
 
467 aa  539  1e-152  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  57.02 
 
 
462 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  55.78 
 
 
467 aa  528  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  56.29 
 
 
468 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  56.42 
 
 
475 aa  528  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  55.48 
 
 
474 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  55.33 
 
 
466 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
474 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
466 aa  502  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
482 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  52.19 
 
 
475 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.29805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  53.56 
 
 
480 aa  488  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  53.56 
 
 
469 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  51.41 
 
 
488 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  54.08 
 
 
475 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0008  amidophosphoribosyltransferase  55.92 
 
 
467 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  54.08 
 
 
481 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
465 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
472 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
478 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  51.61 
 
 
496 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
488 aa  469  1e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
485 aa  470  1e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
474 aa  469  1e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
485 aa  470  1e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3343  amidophosphoribosyltransferase  51.15 
 
 
502 aa  468  1e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  50.85 
 
 
485 aa  467  1e-130  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
465 aa  466  1e-130  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  51.8 
 
 
494 aa  467  1e-130  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
471 aa  466  1e-130  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
471 aa  466  1e-130  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
471 aa  466  1e-130  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
471 aa  465  1e-130  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  51.8 
 
 
494 aa  467  1e-130  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
471 aa  466  1e-130  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
471 aa  466  1e-130  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  49.67 
 
 
471 aa  466  1e-130  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1196  amidophosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
472 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  51.87 
 
 
476 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2072  amidophosphoribosyltransferase  51.29 
 
 
506 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1415  amidophosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
472 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
471 aa  460  1e-128  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  49.67 
 
 
503 aa  461  1e-128  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
495 aa  461  1e-128  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
474 aa  459  1e-128  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  48.92 
 
 
490 aa  458  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  49.02 
 
 
480 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  51.4 
 
 
470 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5556  amidophosphoribosyltransferase  51.11 
 
 
511 aa  455  1e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8991  amidophosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
478 aa  454  1e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
487 aa  452  1e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
484 aa  454  1e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5049  amidophosphoribosyltransferase  49.25 
 
 
534 aa  453  1e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  48.67 
 
 
478 aa  453  1e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  49.27 
 
 
503 aa  453  1e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1222  amidophosphoribosyltransferase  48.9 
 
 
472 aa  448  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.433131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
503 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
446 aa  448  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
470 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  47.92 
 
 
514 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0051  amidophosphoribosyltransferase  48.2 
 
 
479 aa  448  1e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
451 aa  446  1e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
486 aa  447  1e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
514 aa  447  1e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
492 aa  445  1e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  51 
 
 
500 aa  448  1e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  49.79 
 
 
499 aa  447  1e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  51 
 
 
499 aa  445  1e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2109  amidophosphoribosyltransferase  47.68 
 
 
475 aa  447  1e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4758  amidophosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
512 aa  444  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  49.33 
 
 
491 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
473 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  48.47 
 
 
517 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0004  amidophosphoribosyltransferase  49.25 
 
 
493 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.645305  normal  0.0907172 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  47.01 
 
 
473 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
493 aa  441  1e-122  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  49.56 
 
 
491 aa  438  1e-122  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
445 aa  439  1e-122  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
501 aa  441  1e-122  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
482 aa  439  1e-122  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0296  amidophosphoribosyltransferase  48.61 
 
 
505 aa  438  1e-122  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
493 aa  439  1e-122  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
468 aa  440  1e-122  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
491 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1618  amidophosphoribosyltransferase  49.22 
 
 
506 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1137  amidophosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
445 aa  435  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1511  amidophosphoribosyltransferase  49.57 
 
 
466 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.409813  normal  0.0292739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3743  amidophosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
466 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2747  amidophosphoribosyltransferase  48.71 
 
 
484 aa  436  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  49.45 
 
 
491 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>