More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1807 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  55.42 
 
 		 581 aa  659    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  56.28 
 
 		 581 aa  649    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  58 
 
 		 584 aa  682    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  55.65 
 
 		 582 aa  635    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  56.48 
 
 		 582 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1143    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  71.33 
 
 		 559 aa  836    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  56.99 
 
 		 582 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.74 
 
 		 561 aa  632  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.54 
 
 		 592 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.76 
 
 		 558 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  53.36 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  49.11 
 
 		 568 aa  578  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  48.21 
 
 		 559 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  48.92 
 
 		 559 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  41.23 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  40.51 
 
 		 544 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  40.51 
 
 		 543 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  40.51 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  38.22 
 
 		 563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  40.33 
 
 		 543 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  42.94 
 
 		 546 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.84 
 
 		 561 aa  398  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  37.25 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  36.66 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  36.3 
 
 		 561 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  36.89 
 
 		 560 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.58 
 
 		 559 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  40.96 
 
 		 560 aa  381  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  39.61 
 
 		 586 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.67 
 
 		 559 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  34.66 
 
 		 565 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.33 
 
 		 559 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  35.69 
 
 		 558 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  32.78 
 
 		 564 aa  345  1e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.36 
 
 		 501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  32.91 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  33.99 
 
 		 556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  33.51 
 
 		 557 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.87 
 
 		 558 aa  326  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  33.27 
 
 		 558 aa  319  7e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  34.43 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  30.67 
 
 		 599 aa  318  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.63 
 
 		 554 aa  316  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  33.51 
 
 		 558 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  32.9 
 
 		 547 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  32.74 
 
 		 558 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  32.84 
 
 		 551 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  30.62 
 
 		 558 aa  301  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.18 
 
 		 501 aa  296  6e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  32.03 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  31.4 
 
 		 555 aa  286  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  35.06 
 
 		 556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.51 
 
 		 549 aa  283  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  30.05 
 
 		 555 aa  278  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5398  hypothetical protein  43.17 
 
 		 538 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  31.84 
 
 		 549 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  30.91 
 
 		 562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  32.68 
 
 		 550 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0176  2-octaprenylphenol hydroxylase  30.2 
 
 		 547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  33.4 
 
 		 560 aa  273  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  30.88 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  30.88 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  30.98 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  31.33 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  32.37 
 
 		 557 aa  269  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  31.14 
 
 		 557 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  34.86 
 
 		 544 aa  267  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  31.71 
 
 		 552 aa  266  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.37 
 
 		 557 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  30.73 
 
 		 537 aa  266  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.51 
 
 		 563 aa  266  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  30.86 
 
 		 547 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  34.75 
 
 		 585 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  30.46 
 
 		 549 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.46 
 
 		 553 aa  262  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3964  ABC-1 domain-containing protein  32.38 
 
 		 561 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  30.32 
 
 		 537 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  31.29 
 
 		 549 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  32.72 
 
 		 578 aa  260  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  29.45 
 
 		 559 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  30.2 
 
 		 547 aa  258  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  31.09 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.16 
 
 		 551 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  31.98 
 
 		 558 aa  257  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  30.47 
 
 		 549 aa  256  9e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.25 
 
 		 530 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.62 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.62 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.62 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.62 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.62 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.62 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  32.62 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.62 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.7 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.7 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.7 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.7 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.7 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>