More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0563 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0638  catalase  82.78 
 
 		 487 aa  867    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3190  catalase  86.54 
 
 		 486 aa  893    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0631825  normal  0.81248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1070  catalase  87.94 
 
 		 486 aa  905    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3591  catalase  87.37 
 
 		 491 aa  907    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  88.2 
 
 		 491 aa  912    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  88.82 
 
 		 491 aa  916    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3029  catalase  87.94 
 
 		 486 aa  904    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.590786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0945  catalase  87.94 
 
 		 486 aa  904    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0885996  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0563  catalase  100 
 
 		 486 aa  1019    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0908  catalase domain-containing protein  88.15 
 
 		 486 aa  906    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  86.16 
 
 		 493 aa  900    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2941  catalase  81.11 
 
 		 488 aa  848    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0358189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3468  catalase  87.78 
 
 		 491 aa  908    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.482946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  57.41 
 
 		 485 aa  592  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  57.73 
 
 		 480 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  59.88 
 
 		 479 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  58.51 
 
 		 498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  59.59 
 
 		 479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  58.64 
 
 		 484 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  59.88 
 
 		 479 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  59.59 
 
 		 479 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  59.46 
 
 		 481 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00522  catalase  58.06 
 
 		 491 aa  572  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2489  catalase  56.64 
 
 		 484 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.350666  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  55.21 
 
 		 490 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  55.42 
 
 		 490 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  55.01 
 
 		 490 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  55.09 
 
 		 485 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  54.45 
 
 		 493 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  55.11 
 
 		 501 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3054  catalase  54.43 
 
 		 499 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2262  catalase-like  54.89 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0712  Catalase  55.19 
 
 		 484 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3986  catalase  54.87 
 
 		 484 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0355  catalase  53.81 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.692778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2779  catalase  53.67 
 
 		 488 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.432347  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0322  catalase  53.81 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2521  catalase  54.91 
 
 		 484 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0794366  normal  0.723936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1421  catalase  53.67 
 
 		 488 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898508  normal  0.0406547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2662  catalase  54.8 
 
 		 486 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3278  catalase  53.75 
 
 		 478 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0481  catalase  53.31 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  54.56 
 
 		 487 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  52.58 
 
 		 505 aa  531  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5439  Catalase  54.96 
 
 		 485 aa  531  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  54 
 
 		 487 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1932  catalase  53.18 
 
 		 488 aa  529  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2706  Catalase  54.12 
 
 		 499 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  54.04 
 
 		 496 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0383  catalase  53.86 
 
 		 494 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1574  hypothetical protein  52.69 
 
 		 501 aa  525  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0310454 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  52.99 
 
 		 504 aa  528  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0215  catalase  53.73 
 
 		 483 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0864  catalase  53.17 
 
 		 482 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4268  catalase  53.8 
 
 		 483 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338278  normal  0.901094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  52.97 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0269  catalase  54.12 
 
 		 504 aa  527  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146052  normal  0.35045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  51.66 
 
 		 481 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2855  catalase  52.67 
 
 		 479 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1320  catalase  52.67 
 
 		 479 aa  524  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2776  catalase  52.67 
 
 		 479 aa  524  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  52.7 
 
 		 479 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5599  catalase  53.53 
 
 		 481 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.555062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  52.7 
 
 		 478 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1494  Catalase  52.98 
 
 		 485 aa  518  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0618429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1165  Catalase  54.75 
 
 		 547 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0778  Catalase  52.75 
 
 		 507 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0265  catalase  55.6 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1323  catalase  52.82 
 
 		 478 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4001  catalase  53.01 
 
 		 487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  51.14 
 
 		 480 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  53.85 
 
 		 485 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1576  catalase  55.39 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.278462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0656  catalase  52.81 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1387  catalase  55.39 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000679986  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1999  catalase  53.22 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.209766  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  51.56 
 
 		 480 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4417  Catalase  53.18 
 
 		 490 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0279064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1958  catalase  52.06 
 
 		 483 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1759  Catalase  51.84 
 
 		 483 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.191846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  53.53 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1622  Catalase  53.36 
 
 		 500 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468937  normal  0.655187 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0273  catalase  54.58 
 
 		 474 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  52.89 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1057  catalase  53.12 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.852537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2782  Catalase  53.31 
 
 		 494 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0518  Catalase  50.1 
 
 		 483 aa  501  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.309279  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1147  catalase  52.17 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11065  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22460  catalase  51.13 
 
 		 499 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1422  catalase  50.82 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000148509  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1395  catalase  50.82 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000176487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  52.36 
 
 		 493 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  51.75 
 
 		 517 aa  493  9.999999999999999e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0342  Catalase  59.12 
 
 		 556 aa  492  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0903  catalase  50.31 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  52.8 
 
 		 499 aa  488  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0517  Catalase  50.1 
 
 		 483 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0236  catalase  50.93 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3238  Catalase  51.24 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.067006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2094  catalase  50.73 
 
 		 482 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.615987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>