More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0933 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02608  sulfite reductase, beta subunit, NAD(P)-binding, heme-binding  58.78 
 
 		 570 aa  690    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0925  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein, beta-component  58.78 
 
 		 570 aa  690    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294862  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2796  sulfite reductase subunit beta  59.03 
 
 		 577 aa  701    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000451372  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0945  sulfite reductase subunit beta  91.86 
 
 		 565 aa  1091    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0811  sulfite reductase subunit beta  57.89 
 
 		 571 aa  687    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4760  sulfite reductase subunit beta  57.85 
 
 		 584 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3737  sulfite reductase subunit beta  89.91 
 
 		 565 aa  1072    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0828  sulfite reductase subunit beta  57.96 
 
 		 571 aa  691    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3112  sulfite reductase subunit beta  58.96 
 
 		 570 aa  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3310  sulfite reductase subunit beta  56.73 
 
 		 576 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3441  sulfite reductase subunit beta  56.73 
 
 		 576 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25109  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3077  sulfite reductase subunit beta  57.89 
 
 		 570 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.900908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1306  sulfite reductase subunit beta  53.46 
 
 		 579 aa  638    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.482907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0859  sulfite reductase subunit beta  58.5 
 
 		 571 aa  694    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.753141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2903  sulfite reductase subunit beta  59.14 
 
 		 570 aa  694    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0777  sulfite reductase subunit beta  81.67 
 
 		 594 aa  980    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3259  sulfite reductase subunit beta  58.06 
 
 		 570 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.301229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3101  sulfite reductase subunit beta  57.89 
 
 		 570 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3065  sulfite reductase subunit beta  58.96 
 
 		 570 aa  692    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3158  sulfite reductase subunit beta  58.06 
 
 		 570 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790155  normal  0.367122 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2201  sulfite reductase subunit beta  55.2 
 
 		 573 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2891  sulfite reductase subunit beta  58.96 
 
 		 570 aa  692    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3142  sulfite reductase subunit beta  57.89 
 
 		 570 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.719922  normal  0.480652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0403  sulfite reductase subunit beta  58.71 
 
 		 576 aa  692    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3063  sulfite reductase subunit beta  91.15 
 
 		 565 aa  1083    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0933  sulfite reductase subunit beta  100 
 
 		 562 aa  1168    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0666  sulfite reductase subunit beta  81.77 
 
 		 565 aa  985    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3226  sulfite reductase subunit beta  58.6 
 
 		 570 aa  687    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73638  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0217  sulfite reductase subunit beta  55.4 
 
 		 566 aa  649    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03588  sulfite reductase subunit beta  60.78 
 
 		 573 aa  719    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0654  sulfite reductase subunit beta  82.12 
 
 		 565 aa  992    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3526  sulfite reductase subunit beta  57.25 
 
 		 577 aa  689    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.19432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4038  sulfite reductase subunit beta  58.68 
 
 		 569 aa  692    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3364  sulfite reductase subunit beta  57.6 
 
 		 577 aa  688    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0920  sulfite reductase subunit beta  91.68 
 
 		 565 aa  1088    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0954  sulfite reductase subunit beta  91.68 
 
 		 565 aa  1088    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4017  sulfite reductase subunit beta  58.96 
 
 		 570 aa  692    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.96721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3079  sulfite reductase subunit beta  90.09 
 
 		 565 aa  1073    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0893  sulfite reductase subunit beta  90.09 
 
 		 565 aa  1073    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3192  sulfite reductase subunit beta  94.48 
 
 		 563 aa  1111    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3806  sulfite reductase subunit beta  80.78 
 
 		 587 aa  971    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763742 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3415  sulfite reductase subunit beta  91.68 
 
 		 565 aa  1088    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00004  sulfite reductase subunit beta  58.96 
 
 		 578 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0856  sulfite reductase subunit beta  90.09 
 
 		 565 aa  1073    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0949  sulfite reductase subunit beta  58.78 
 
 		 570 aa  690    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002351  sulfite reductase [NADPH] hemoprotein beta-component  57.96 
 
 		 578 aa  694    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0210403  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02571  hypothetical protein  58.78 
 
 		 570 aa  690    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2838  sulfite reductase subunit beta  59.96 
 
 		 571 aa  699    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3306  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein, beta-component  54.37 
 
 		 564 aa  653    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3435  sulfite reductase subunit beta  59.21 
 
 		 562 aa  697    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1804  sulfite reductase subunit beta  55.28 
 
 		 602 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1783  sulfite reductase subunit beta  54.96 
 
 		 616 aa  631  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2237  sulfite reductase subunit beta  54.74 
 
 		 657 aa  626  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.327288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2195  sulfite reductase subunit beta  54.92 
 
 		 612 aa  627  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2513  sulfite reductase subunit beta  54.74 
 
 		 612 aa  627  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5484  sulfite reductase subunit beta  55.54 
 
 		 602 aa  620  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05500  sulfite reductase, putative  54.26 
 
 		 1885 aa  615  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2190  sulfite reductase subunit beta  54.23 
 
 		 572 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2695  sulfite reductase subunit beta  53.7 
 
 		 575 aa  600  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0702337  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0838  sulfite reductase subunit beta  53.39 
 
 		 568 aa  595  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0751  sulfite reductase subunit beta  53.37 
 
 		 568 aa  594  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02132  sulfite reductase subunit beta  53.47 
 
 		 568 aa  590  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130377  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07600  SE, putative sulfite reductase beta subunit-hemoprotein,ferredoxin oxidoreductase (Eurofung)  49.56 
 
 		 1528 aa  566  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  0.178099 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0591  sulfite reductase subunit beta  51.18 
 
 		 576 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0776891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2426  sulfite reductase subunit beta  51.52 
 
 		 578 aa  568  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0422981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0683  sulfite reductase subunit beta  50.99 
 
 		 576 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2721  Sulfite reductase (NADPH)  50.09 
 
 		 563 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000160645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3122  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  50.09 
 
 		 563 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67906  Sulfite reductase [NADPH] beta subunit (Extracellular matrix protein 17)  46.45 
 
 		 934 aa  542  1e-153  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0700093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2799  sulfite reductase subunit beta  48.55 
 
 		 557 aa  535  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507806  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2432  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  47.45 
 
 		 581 aa  509  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3309  hypothetical protein  43.04 
 
 		 562 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.586333  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2758  Sulfite reductase (NADPH)  41.81 
 
 		 571 aa  444  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0852  Sulfite reductase (NADPH)  42.21 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2423  Sulfite reductase (NADPH)  40.51 
 
 		 560 aa  425  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.230448  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1640  sulfite reductase subunit beta  40.77 
 
 		 638 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1667  sulfite reductase subunit beta  40.94 
 
 		 638 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0019  sulfite reductase subunit beta  40.96 
 
 		 624 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.508034 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1294  Sulfite reductase (NADPH)  40.59 
 
 		 546 aa  424  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5043  sulfite reductase subunit beta  40.21 
 
 		 650 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2931  sulfite reductase subunit beta  37.61 
 
 		 646 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3544  sulfite reductase subunit beta  38.33 
 
 		 902 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5022  sulfite reductase, ferredoxin dependent  38.91 
 
 		 637 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.299313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3868  sulfite reductase subunit beta  38.13 
 
 		 660 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24374  predicted protein  35.5 
 
 		 633 aa  350  3e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.152438  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25282  sulfite reductase  35.59 
 
 		 690 aa  350  4e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1227  sulfite reductase subunit beta  36.1 
 
 		 580 aa  344  2e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.447806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16711  sulfite reductase subunit beta  35.02 
 
 		 598 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1242  sulfite reductase subunit beta  34.49 
 
 		 580 aa  331  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.704762  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0766  sulfite reductase subunit beta  35.51 
 
 		 595 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.958456  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08201  sulfite reductase subunit beta  35.4 
 
 		 595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08181  sulfite reductase subunit beta  35.16 
 
 		 595 aa  323  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08251  sulfite reductase subunit beta  34.69 
 
 		 596 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10051  sulfite reductase subunit beta  34.8 
 
 		 598 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.155233  normal  0.609504 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07941  sulfite reductase subunit beta  33.74 
 
 		 601 aa  320  6e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0162  sulfite reductase subunit beta  33.39 
 
 		 601 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75375  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0705  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.54 
 
 		 630 aa  211  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0961  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  29.03 
 
 		 599 aa  195  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000332395  normal  0.245939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  27.94 
 
 		 569 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.53 
 
 		 567 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>