More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0893 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02608  sulfite reductase, beta subunit, NAD(P)-binding, heme-binding  59.18 
 
 		 570 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0925  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein, beta-component  59.18 
 
 		 570 aa  700    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.294862  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00004  sulfite reductase subunit beta  59.36 
 
 		 578 aa  710    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3101  sulfite reductase subunit beta  58.29 
 
 		 570 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.159478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3142  sulfite reductase subunit beta  58.29 
 
 		 570 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.719922  normal  0.480652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4760  sulfite reductase subunit beta  59.61 
 
 		 584 aa  730    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3077  sulfite reductase subunit beta  58.47 
 
 		 570 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.900908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3737  sulfite reductase subunit beta  99.12 
 
 		 565 aa  1167    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3310  sulfite reductase subunit beta  57.86 
 
 		 576 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2201  sulfite reductase subunit beta  56.09 
 
 		 573 aa  650    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3063  sulfite reductase subunit beta  95.75 
 
 		 565 aa  1135    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2796  sulfite reductase subunit beta  58.71 
 
 		 577 aa  700    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000451372  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3158  sulfite reductase subunit beta  58.11 
 
 		 570 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790155  normal  0.367122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0828  sulfite reductase subunit beta  58.72 
 
 		 571 aa  704    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1306  sulfite reductase subunit beta  53.64 
 
 		 579 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.482907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2903  sulfite reductase subunit beta  59.54 
 
 		 570 aa  704    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3415  sulfite reductase subunit beta  95.58 
 
 		 565 aa  1133    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002351  sulfite reductase [NADPH] hemoprotein beta-component  58.47 
 
 		 578 aa  709    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0210403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0777  sulfite reductase subunit beta  82.74 
 
 		 594 aa  998    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4017  sulfite reductase subunit beta  59.36 
 
 		 570 aa  702    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.96721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3364  sulfite reductase subunit beta  58.36 
 
 		 577 aa  703    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2891  sulfite reductase subunit beta  59.36 
 
 		 570 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2195  sulfite reductase subunit beta  55.99 
 
 		 612 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3112  sulfite reductase subunit beta  59.36 
 
 		 570 aa  702    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3226  sulfite reductase subunit beta  59.54 
 
 		 570 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.73638  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3806  sulfite reductase subunit beta  82.21 
 
 		 587 aa  994    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0933  sulfite reductase subunit beta  90.09 
 
 		 562 aa  1073    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03588  sulfite reductase subunit beta  60.64 
 
 		 573 aa  729    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0654  sulfite reductase subunit beta  84.42 
 
 		 565 aa  1023    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0217  sulfite reductase subunit beta  55.81 
 
 		 566 aa  662    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0949  sulfite reductase subunit beta  59.18 
 
 		 570 aa  701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0811  sulfite reductase subunit beta  58.29 
 
 		 571 aa  701    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1783  sulfite reductase subunit beta  54.96 
 
 		 616 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0403  sulfite reductase subunit beta  58.82 
 
 		 576 aa  698    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00409263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3306  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein, beta-component  54.61 
 
 		 564 aa  663    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4038  sulfite reductase subunit beta  58.72 
 
 		 569 aa  700    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3441  sulfite reductase subunit beta  57.86 
 
 		 576 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0859  sulfite reductase subunit beta  59.07 
 
 		 571 aa  708    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.753141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3079  sulfite reductase subunit beta  99.82 
 
 		 565 aa  1175    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0893  sulfite reductase subunit beta  100 
 
 		 565 aa  1176    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3192  sulfite reductase subunit beta  89.89 
 
 		 563 aa  1065    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3259  sulfite reductase subunit beta  58.65 
 
 		 570 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.301229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0666  sulfite reductase subunit beta  83.54 
 
 		 565 aa  1006    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528094 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0954  sulfite reductase subunit beta  95.58 
 
 		 565 aa  1133    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0945  sulfite reductase subunit beta  95.22 
 
 		 565 aa  1129    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0856  sulfite reductase subunit beta  100 
 
 		 565 aa  1176    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3065  sulfite reductase subunit beta  59.36 
 
 		 570 aa  702    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02571  hypothetical protein  59.18 
 
 		 570 aa  700    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1804  sulfite reductase subunit beta  56.17 
 
 		 602 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2838  sulfite reductase subunit beta  60 
 
 		 571 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3435  sulfite reductase subunit beta  59.96 
 
 		 562 aa  704    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0920  sulfite reductase subunit beta  95.4 
 
 		 565 aa  1132    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3526  sulfite reductase subunit beta  58.01 
 
 		 577 aa  704    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.19432  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2513  sulfite reductase subunit beta  55.46 
 
 		 612 aa  632  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2237  sulfite reductase subunit beta  55.46 
 
 		 657 aa  632  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.327288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5484  sulfite reductase subunit beta  56.07 
 
 		 602 aa  628  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05500  sulfite reductase, putative  54 
 
 		 1885 aa  618  1e-176  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.268676  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2190  sulfite reductase subunit beta  53.78 
 
 		 572 aa  618  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2695  sulfite reductase subunit beta  54.74 
 
 		 575 aa  615  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0702337  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0838  sulfite reductase subunit beta  53.66 
 
 		 568 aa  595  1e-169  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0751  sulfite reductase subunit beta  53.85 
 
 		 568 aa  593  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02132  sulfite reductase subunit beta  52.46 
 
 		 568 aa  585  1e-166  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2426  sulfite reductase subunit beta  52.22 
 
 		 578 aa  580  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0422981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2721  Sulfite reductase (NADPH)  50.36 
 
 		 563 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000160645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3122  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  50.36 
 
 		 563 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07600  SE, putative sulfite reductase beta subunit-hemoprotein,ferredoxin oxidoreductase (Eurofung)  49.47 
 
 		 1528 aa  569  1e-161  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  0.178099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0683  sulfite reductase subunit beta  51.44 
 
 		 576 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0591  sulfite reductase subunit beta  51.44 
 
 		 576 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0776891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2799  sulfite reductase subunit beta  49.55 
 
 		 557 aa  548  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507806  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67906  Sulfite reductase [NADPH] beta subunit (Extracellular matrix protein 17)  46.96 
 
 		 934 aa  546  1e-154  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0700093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2432  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  48.27 
 
 		 581 aa  524  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3309  hypothetical protein  44.22 
 
 		 562 aa  475  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.586333  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0852  Sulfite reductase (NADPH)  43.5 
 
 		 566 aa  456  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2758  Sulfite reductase (NADPH)  41.59 
 
 		 571 aa  449  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36234  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1667  sulfite reductase subunit beta  41.33 
 
 		 638 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0019  sulfite reductase subunit beta  41.14 
 
 		 624 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.508034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1640  sulfite reductase subunit beta  41.16 
 
 		 638 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2423  Sulfite reductase (NADPH)  40.51 
 
 		 560 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.230448  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1294  Sulfite reductase (NADPH)  40.73 
 
 		 546 aa  432  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5043  sulfite reductase subunit beta  40.43 
 
 		 650 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5022  sulfite reductase, ferredoxin dependent  39.93 
 
 		 637 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.299313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3544  sulfite reductase subunit beta  38.53 
 
 		 902 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2931  sulfite reductase subunit beta  38.12 
 
 		 646 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3868  sulfite reductase subunit beta  39.76 
 
 		 660 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_25282  sulfite reductase  37.87 
 
 		 690 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24374  predicted protein  36.49 
 
 		 633 aa  363  3e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.152438  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1227  sulfite reductase subunit beta  35.93 
 
 		 580 aa  348  1e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.447806 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16711  sulfite reductase subunit beta  35.8 
 
 		 598 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1242  sulfite reductase subunit beta  34.66 
 
 		 580 aa  335  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.704762  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0766  sulfite reductase subunit beta  35.69 
 
 		 595 aa  329  9e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.958456  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08201  sulfite reductase subunit beta  35.75 
 
 		 595 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08251  sulfite reductase subunit beta  35.65 
 
 		 596 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08181  sulfite reductase subunit beta  35.51 
 
 		 595 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.900462  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07941  sulfite reductase subunit beta  33.57 
 
 		 601 aa  319  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10051  sulfite reductase subunit beta  33.82 
 
 		 598 aa  319  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.155233  normal  0.609504 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0162  sulfite reductase subunit beta  33.57 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75375  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0705  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.98 
 
 		 630 aa  209  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0961  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  29.2 
 
 		 599 aa  200  5e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000332395  normal  0.245939 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  28.09 
 
 		 540 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  27.9 
 
 		 540 aa  154  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>