More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2810 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2810  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  100 
 
 
188 aa  391  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  1.62826e-07 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0928  peroxiredoxin  89.84 
 
 
189 aa  357  6e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0792  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  89.3 
 
 
189 aa  354  3e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.124423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  88.77 
 
 
189 aa  351  3e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.956436  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0958  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  87.17 
 
 
189 aa  348  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0896  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  87.17 
 
 
189 aa  348  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0617  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  86.63 
 
 
189 aa  348  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3222  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  86.1 
 
 
189 aa  347  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0801  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  86.1 
 
 
189 aa  347  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3325  alkyl hydroperoxide reductase/Thiol specific antioxidant/Mal allergen  86.1 
 
 
189 aa  347  6e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0829  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  86.1 
 
 
189 aa  346  1e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.520161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0849  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  85.56 
 
 
205 aa  345  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3012  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  86.63 
 
 
189 aa  345  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3638  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  85.56 
 
 
189 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3517  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  85.56 
 
 
189 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3444  peroxiredoxin  85.03 
 
 
189 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0522  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  85.56 
 
 
189 aa  342  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1066  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  81.82 
 
 
189 aa  338  3e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4717  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  82.89 
 
 
189 aa  337  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1953  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  76.22 
 
 
187 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0830467  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3984  peroxiredoxin  75.68 
 
 
187 aa  308  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.682619  normal  0.347189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4495  peroxiredoxin  75.14 
 
 
187 aa  307  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3501  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  75.14 
 
 
187 aa  307  7e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4091  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.05 
 
 
187 aa  304  4e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3432  peroxiredoxin  74.05 
 
 
187 aa  304  4e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.05 
 
 
187 aa  304  4e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1926  alkyl hydroperoxide reductase, subunit c  74.05 
 
 
187 aa  300  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2045  alkyl hydroperoxide reductase protein  74.59 
 
 
187 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1205  hypothetical protein  73.51 
 
 
187 aa  299  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  4.64987e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0757  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  74.59 
 
 
187 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3256  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.05 
 
 
187 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3534  peroxiredoxin  74.05 
 
 
187 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.734574  normal  0.05332 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0667  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  74.59 
 
 
187 aa  299  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.830328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2439  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  74.05 
 
 
187 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1072  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  74.05 
 
 
187 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2046  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  74.05 
 
 
187 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205648  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3657  peroxiredoxin  72.97 
 
 
187 aa  298  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1316  normal  0.64975 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1786  alkyl hydroperoxide reductase, subunit c  74.05 
 
 
187 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.998152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0779  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  74.05 
 
 
187 aa  298  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.867109  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3187  peroxiredoxin  72.97 
 
 
187 aa  295  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5403  peroxiredoxin  73.51 
 
 
187 aa  295  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  1.23087e-10  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2095  alkyl hydroperoxide reductase protein  68.82 
 
 
187 aa  294  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1197  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  73.66 
 
 
189 aa  290  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  8.54978e-11  normal  0.901596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2925  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  72.43 
 
 
187 aa  288  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333521  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  70.97 
 
 
187 aa  287  5e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2401  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  69.31 
 
 
190 aa  285  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.548664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45910  Alkyl hydroperoxide reductase  69.35 
 
 
187 aa  283  1e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2139  peroxiredoxin  70.21 
 
 
188 aa  283  1e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.441627  hitchhiker  0.00203852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2975  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  70.81 
 
 
187 aa  281  3e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.244311  normal  0.019621 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04762  alkyl hydroperoxide reductase c22 protein  70.81 
 
 
185 aa  281  5e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3108  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  70.81 
 
 
187 aa  281  5e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00552107  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0784  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  67.2 
 
 
187 aa  281  6e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001044  alkyl hydroperoxide reductase protein C  70.27 
 
 
185 aa  280  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3044  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  66.67 
 
 
190 aa  278  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4880  peroxiredoxin  68.82 
 
 
187 aa  276  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1797  putative alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  67.02 
 
 
188 aa  276  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2078  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.02 
 
 
188 aa  275  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0832179  normal  0.5898 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0766  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.28 
 
 
187 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.713597 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0705  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.28 
 
 
187 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0647  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.28 
 
 
187 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0661  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.28 
 
 
187 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0720  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.28 
 
 
187 aa  275  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  68.65 
 
 
185 aa  274  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3454  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.2 
 
 
187 aa  274  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01774  Peroxiredoxin  70.27 
 
 
187 aa  273  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1145  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.74 
 
 
187 aa  273  9e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.731724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4220  peroxiredoxin  67.74 
 
 
187 aa  273  9e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.176986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00563  hypothetical protein  67.2 
 
 
187 aa  273  1e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0626  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.2 
 
 
187 aa  273  1e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0657  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.2 
 
 
187 aa  273  1e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0626  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.2 
 
 
187 aa  273  1e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00574  alkyl hydroperoxide reductase, C22 subunit  67.2 
 
 
187 aa  273  1e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.355104  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3019  peroxiredoxin  67.2 
 
 
187 aa  273  1e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3038  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.2 
 
 
187 aa  273  1e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0519  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.2 
 
 
187 aa  273  1e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0691  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.2 
 
 
187 aa  273  1e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.759293  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3574  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  66.67 
 
 
187 aa  271  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3730  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  66.67 
 
 
187 aa  271  5e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3927  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  66.67 
 
 
187 aa  271  5e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3838  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.03 
 
 
187 aa  270  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21220  peroxiredoxin  67.03 
 
 
187 aa  269  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00898795  normal  0.214618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1418  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  66.13 
 
 
187 aa  268  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2882  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  66.13 
 
 
187 aa  266  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000958869  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0317  alkyl hydroperoxide reductase  67.57 
 
 
187 aa  265  3e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0330  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.57 
 
 
187 aa  265  3e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0314  alkyl hydroperoxide reductase (peroxiredoxin)  67.57 
 
 
187 aa  265  3e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0345  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.57 
 
 
187 aa  265  3e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0440  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  67.57 
 
 
187 aa  265  3e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0377  peroxiredoxin  67.57 
 
 
187 aa  265  3e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0439  peroxiredoxin  67.57 
 
 
187 aa  265  3e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2369  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  65.05 
 
 
187 aa  265  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0325  peroxiredoxin  67.03 
 
 
187 aa  263  9e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0392  peroxiredoxin  67.03 
 
 
187 aa  263  9e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4926  peroxiredoxin  67.03 
 
 
187 aa  263  9e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5072  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  65.59 
 
 
187 aa  263  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.911201  normal  0.100881 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0476  peroxiredoxin  62.37 
 
 
187 aa  259  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.01848e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0315  peroxiredoxin  65.41 
 
 
187 aa  258  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00856528  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03180  peroxiredoxin  61.83 
 
 
187 aa  258  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0003  peroxiredoxin  60.22 
 
 
187 aa  257  8e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47227e-06 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1242  peroxiredoxin  61.83 
 
 
187 aa  257  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>