41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0052 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0052  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  745  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.962002  unclonable  1.16494e-05 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1420  Domain of unknown function DUF1814  32.49 
 
 
338 aa  152  9e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0394  hypothetical protein  30.5 
 
 
342 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.176763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1625  hypothetical protein  33.23 
 
 
339 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1328  hypothetical protein  33.74 
 
 
348 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  2.61253e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0434  hypothetical protein  32.4 
 
 
339 aa  140  4e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.421274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3510  hypothetical protein  30.7 
 
 
338 aa  128  1e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0233034  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1225  hypothetical protein  30.7 
 
 
338 aa  128  1e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3046  hypothetical protein  31.71 
 
 
338 aa  127  4e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.137225  normal  0.0781322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3057  protein of unknown function DUF1814  30.61 
 
 
338 aa  120  5e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1776  hypothetical protein  29.75 
 
 
326 aa  115  1e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3050  hypothetical protein  30.09 
 
 
345 aa  115  1e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.818716 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0754  hypothetical protein  26.79 
 
 
332 aa  114  2e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1821  hypothetical protein  28.66 
 
 
327 aa  114  4e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf137  hypothetical protein  28.75 
 
 
346 aa  108  2e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0341957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0784  hypothetical protein  27.52 
 
 
368 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4355  hypothetical protein  28.32 
 
 
341 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678013  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2490  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4292  hypothetical protein  26.07 
 
 
344 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0218  hypothetical protein  27.38 
 
 
331 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0890  hypothetical protein  28.29 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  8.38663e-07  hitchhiker  1.0514e-10 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7702  hypothetical protein  27.56 
 
 
347 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2334  hypothetical protein  26.05 
 
 
359 aa  92.8  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.937968  normal  0.0991632 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5265  hypothetical protein  28.74 
 
 
348 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00288645  unclonable  2.0149e-05 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0281  hypothetical protein  26.38 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1847  hypothetical protein  26.04 
 
 
361 aa  79.3  9e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.283474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3786  hypothetical protein  31.4 
 
 
335 aa  74.7  2e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0294  hypothetical protein  27.59 
 
 
329 aa  60.8  4e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1960  hypothetical protein  45.45 
 
 
327 aa  58.2  2e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0509543  normal  0.220534 
 
 
-
 
NC_002950  PG0848  hypothetical protein  32.32 
 
 
332 aa  54.7  2e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64923e-06 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2171  hypothetical protein  27.62 
 
 
314 aa  52.8  9e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.690317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1569  hypothetical protein  25.31 
 
 
321 aa  52  1e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110325  normal  0.0638438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0814  hypothetical protein  44.07 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2408  hypothetical protein  44.83 
 
 
308 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2452  hypothetical protein  39.76 
 
 
308 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.48779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2544  hypothetical protein  39.76 
 
 
318 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4654  Domain of unknown function DUF1814  44.07 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.929553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2690  hypothetical protein  38.67 
 
 
187 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0213  hypothetical protein  34.82 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.703328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3417  hypothetical protein  24.61 
 
 
315 aa  43.1  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1303  hypothetical protein  36.62 
 
 
322 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.240695  hitchhiker  7.78686e-10 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>