More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1251 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
100 aa  199  1e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  78.12 
 
 
104 aa  158  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  77.78 
 
 
102 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  72.63 
 
 
97 aa  140  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  73.68 
 
 
97 aa  139  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  73.68 
 
 
97 aa  139  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  70.53 
 
 
97 aa  134  3e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  69.47 
 
 
97 aa  134  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  70.53 
 
 
97 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  69.47 
 
 
97 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  69.47 
 
 
97 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  68.82 
 
 
98 aa  129  1e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  69.47 
 
 
98 aa  128  2e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  69.47 
 
 
98 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  67.37 
 
 
98 aa  127  5e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  68.42 
 
 
98 aa  127  5e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  67.37 
 
 
98 aa  127  5e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  65.62 
 
 
99 aa  125  2e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  70.79 
 
 
111 aa  124  4e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  68.04 
 
 
102 aa  124  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  65.26 
 
 
98 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  63.92 
 
 
98 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  67.01 
 
 
103 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  62.89 
 
 
99 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  61.86 
 
 
99 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  60 
 
 
97 aa  120  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.43862e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  60 
 
 
97 aa  120  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.42276e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  65.62 
 
 
98 aa  120  8e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  61.86 
 
 
99 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  68.54 
 
 
113 aa  120  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  63.16 
 
 
104 aa  118  2e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  60.42 
 
 
99 aa  118  2e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  63.54 
 
 
98 aa  117  4e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  65.59 
 
 
98 aa  117  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  60.42 
 
 
96 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  63.54 
 
 
102 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  1.15816e-05 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  64.52 
 
 
98 aa  114  4e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  61.96 
 
 
98 aa  110  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  58.95 
 
 
98 aa  108  2e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001740  LSU ribosomal protein L23p (L23Ae)  56.84 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  4.23409e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00732  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4274  50S ribosomal protein L23  58.7 
 
 
98 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  5.76147e-06  unclonable  3.82148e-12 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
100 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.67938e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  57.89 
 
 
100 aa  97.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.25205e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0363  50S ribosomal protein L23  64.13 
 
 
98 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.674139  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0322  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00637694  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1718  50S ribosomal protein L23  64.13 
 
 
98 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0786377  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.43767e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.18285e-09  hitchhiker  1.27878e-09 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
101 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.282e-06  unclonable  5.66696e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
101 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  4.63544e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
101 aa  94.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  2.28479e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
101 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.95974e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
101 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.51497e-07  unclonable  7.70372e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
101 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  6.98801e-06  unclonable  1.84888e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  56.84 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  55.68 
 
 
97 aa  93.2  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.31875e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2532  50S ribosomal protein L23  64.13 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128178  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  9.57762e-07  unclonable  6.93674e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0160  50S ribosomal protein L23  57.14 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  1.44621e-05  decreased coverage  4.12321e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4688  50S ribosomal protein L23  59.55 
 
 
99 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.343e-07  unclonable  1.69741e-08 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0423  50S ribosomal protein L23P  54.35 
 
 
98 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0123777  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0297  ribosomal L23 protein  51.69 
 
 
98 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.30523e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  57.14 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  4.57129e-06  hitchhiker  6.22944e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2838  50S ribosomal protein L23  55.32 
 
 
104 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  2.38806e-07  normal  0.241874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4315  50S ribosomal protein L23  57.3 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  2.09174e-06  unclonable  5.39649e-11 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3744  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.0751e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3802  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00374922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1926  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  5.97608e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0269  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000217193  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0350  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  1.62065e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3480  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  3.57625e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2630  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  2.25404e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3066  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  1.81446e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
100 aa  88.6  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3774  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  5.18594e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0251  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  3.96316e-07  normal  0.0882759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0329  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  1.04942e-07  normal  0.0187974 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2757  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  3.00049e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3449  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  2.44074e-12  normal  0.012759 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0278  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  3.01066e-11  normal  0.113282 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3167  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  1.45787e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3336  50S ribosomal protein L23  49 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  1.12822e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  54.84 
 
 
99 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3997  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.37329e-06 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
98 aa  87  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 
99 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 
99 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 
99 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  1.9112e-08  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 
99 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  1.64588e-07 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0471  50S ribosomal protein L23  56.04 
 
 
100 aa  86.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.95002e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3642  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.01067e-08  hitchhiker  1.69859e-11 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4911  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  7.71327e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0316  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
104 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.11744e-08  decreased coverage  0.00276856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.08369e-09  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  49.47 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.48684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0340  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586276  hitchhiker  0.000885961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>