25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2702 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2702  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  762    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02654  hypothetical protein  38.04 
 
 		 347 aa  248  9e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2238  hypothetical protein  41.23 
 
 		 352 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.050189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2190  hypothetical protein  39 
 
 		 340 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.323373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2387  hypothetical protein  38.64 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2267  hypothetical protein  38.71 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2007  hypothetical protein  38.42 
 
 		 359 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.215237  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0068  hypothetical protein  35.16 
 
 		 374 aa  205  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0090  hypothetical protein  36.34 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0087  hypothetical protein  36.34 
 
 		 360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4265  hypothetical protein  36.34 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2400  hypothetical protein  36.89 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0084  hypothetical protein  36.57 
 
 		 360 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0075  hypothetical protein  38.9 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4181  hypothetical protein  34.68 
 
 		 317 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3967  hypothetical protein  33.24 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2207  hypothetical protein  44.12 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2532  hypothetical protein  27.57 
 
 		 693 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1300  hypothetical protein  27.57 
 
 		 469 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1015  hypothetical protein  27.57 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0328139  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1466  hypothetical protein  27.32 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0551  hypothetical protein  26.63 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0932093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1355  hypothetical protein  26.63 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.648024  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1277  hypothetical protein  26.63 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273168  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0280  hypothetical protein  27.57 
 
 		 340 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>