More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1919 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1919  glutaredoxin-related protein  100 
 
 		 110 aa  228  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00265167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1964  glutaredoxin-like protein  88.18 
 
 		 113 aa  206  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0459539  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1688  glutaredoxin-like protein  86.36 
 
 		 110 aa  205  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1748  glutaredoxin-like protein  84.55 
 
 		 113 aa  204  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1820  glutaredoxin-like protein  86.36 
 
 		 110 aa  204  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1640  glutaredoxin-like protein  85.45 
 
 		 110 aa  204  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000581694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1573  glutaredoxin-like protein  85.45 
 
 		 110 aa  204  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000259728  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1648  glutaredoxin-like protein  85.45 
 
 		 110 aa  204  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000432966  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2502  glutaredoxin-like protein  85.45 
 
 		 110 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000230073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1783  glutaredoxin-like protein  85.45 
 
 		 110 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000151147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1640  glutaredoxin-like protein  84.4 
 
 		 111 aa  203  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000518322  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1776  glutaredoxin-like protein  85.45 
 
 		 110 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000936402  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1835  glutaredoxin-like protein  86.24 
 
 		 116 aa  201  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  0.937939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2880  glutaredoxin domain-containing protein  84.55 
 
 		 110 aa  201  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2160  glutaredoxin-like protein  85.32 
 
 		 116 aa  201  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.277546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2444  glutaredoxin-like protein  83.49 
 
 		 115 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72039  normal  0.0565869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2386  hypothetical protein  75.93 
 
 		 116 aa  184  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0290699  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1732  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.358242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01614  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1544  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000387905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1850  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  75.93 
 
 		 115 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02749  putative glutaredoxin like protein  75.93 
 
 		 116 aa  183  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  73.64 
 
 		 110 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03013  hypothetical protein  78.1 
 
 		 116 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002935  glutaredoxin-related protein  77.14 
 
 		 116 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000192998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2670  hypothetical protein  74.07 
 
 		 116 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0262215  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1034  glutaredoxin-like protein  75.47 
 
 		 108 aa  179  8.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000907202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1686  glutaredoxin-like protein  73.15 
 
 		 114 aa  179  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1758  hypothetical protein  70 
 
 		 116 aa  178  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1866  hypothetical protein  70 
 
 		 116 aa  178  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2569  hypothetical protein  70 
 
 		 116 aa  178  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1718  hypothetical protein  72.22 
 
 		 116 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000856261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2198  hypothetical protein  71.3 
 
 		 115 aa  175  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1859  putative glutaredoxin  71.56 
 
 		 111 aa  174  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1396  glutaredoxin-like protein  71.43 
 
 		 109 aa  173  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.420177  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  69.52 
 
 		 108 aa  166  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  69.52 
 
 		 108 aa  166  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3475  glutaredoxin,-like protein  71.72 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2449  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182264  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  67.62 
 
 		 108 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  63.89 
 
 		 112 aa  159  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  68.32 
 
 		 111 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  65.71 
 
 		 108 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  67.33 
 
 		 113 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  60.91 
 
 		 110 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1110  glutaredoxin-like protein  66.34 
 
 		 111 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  63.46 
 
 		 108 aa  153  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  63.46 
 
 		 108 aa  153  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  68.69 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4331  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 		 111 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0086  glutaredoxin-related protein  59.63 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0938468  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3388  glutaredoxin-like protein  59.62 
 
 		 109 aa  148  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.459255  normal  0.239887 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  59.62 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  59.62 
 
 		 115 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0963  glutaredoxin-like protein  61.05 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957456 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  53.21 
 
 		 110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1242  glutaredoxin-related protein  58.51 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1150  glutaredoxin-like protein  58.51 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  49.07 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  53.27 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  47.62 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0596  glutaredoxin-like protein  53.06 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.097988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  49.52 
 
 		 129 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  52.88 
 
 		 111 aa  127  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  51.52 
 
 		 109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  48.48 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  51.96 
 
 		 106 aa  120  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  46.08 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0491  glutaredoxin-related protein  45.54 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249105  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  48.42 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  48.57 
 
 		 105 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  49.06 
 
 		 106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51060  glutaredoxin-related protein  52.48 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0783867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  49.5 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  45.28 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  45.28 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1610  glutaredoxin-like protein  56.04 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  42.57 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  46.67 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  40.74 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  47 
 
 		 102 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  47 
 
 		 102 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  47 
 
 		 102 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  48 
 
 		 103 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  47 
 
 		 102 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  47 
 
 		 102 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  47 
 
 		 102 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  47 
 
 		 102 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1480  glutaredoxin  44.44 
 
 		 99 aa  110  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.516796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>