26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1432 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1432  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0585  hypothetical protein  59.15 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7652  hypothetical protein  61.07 
 
 		 142 aa  157  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.124925 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0120  hypothetical protein  59.09 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0036  hypothetical protein  56.82 
 
 		 142 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1772  hypothetical protein  52.24 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0166  hypothetical protein  42.42 
 
 		 134 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1186  hypothetical protein  35.94 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2403  hypothetical protein  37.04 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000119394  hitchhiker  0.00120616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2404  hypothetical protein  41.59 
 
 		 174 aa  94  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000403861  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1128  hypothetical protein  34.38 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2672  hypothetical protein  33.82 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0711061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0943  hypothetical protein  39.09 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1324  hypothetical protein  33.58 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00524213  normal  0.18086 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2822  conserved hypothetical secreted protein  31.25 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2476  hypothetical protein  31.9 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00155227  normal  0.285117 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3898  hypothetical protein  31.34 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1573  hypothetical protein  27.21 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0760807  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4779  hypothetical protein  29.85 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.52313  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1981  hypothetical protein  31.54 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4169  hypothetical protein  29.2 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5090  hypothetical protein  28.1 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  33.75 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4253  hypothetical protein  27.87 
 
 		 164 aa  40.4  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>